More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3780 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  93.85 
 
 		 179 aa  347  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  84.36 
 
 		 179 aa  309  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  78.21 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  77.65 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  75.84 
 
 		 178 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  75.84 
 
 		 178 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  74.72 
 
 		 178 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  75.28 
 
 		 178 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  70.95 
 
 		 177 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  69.27 
 
 		 177 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  69.27 
 
 		 177 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  67.04 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  67.04 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  67.04 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  67.04 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  67.04 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  66.48 
 
 		 177 aa  246  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  66.48 
 
 		 177 aa  246  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  65.36 
 
 		 177 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  65.36 
 
 		 177 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  65.36 
 
 		 177 aa  244  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  64.25 
 
 		 177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  67.23 
 
 		 177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  68.05 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  64.16 
 
 		 177 aa  238  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  63.13 
 
 		 177 aa  237  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  64.25 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  63.69 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  63.13 
 
 		 177 aa  234  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  61.63 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  63.58 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  60.89 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  64.16 
 
 		 171 aa  228  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  65.36 
 
 		 177 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  65.36 
 
 		 177 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  65.36 
 
 		 177 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  62.15 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  65.92 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  61.45 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  63.69 
 
 		 177 aa  221  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  62.9 
 
 		 186 aa  220  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  62.57 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  64.25 
 
 		 200 aa  214  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  60.89 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  60.89 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  60.67 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  57.56 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  58.24 
 
 		 177 aa  207  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  58.1 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  48.48 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  51.25 
 
 		 169 aa  154  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  47.09 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  43.11 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  39.29 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  40.61 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  43.9 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  41.18 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.58 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.51 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  37.89 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  37.89 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  41.38 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  37.27 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  38.56 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  39.75 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  36.65 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  36.02 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  42.21 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  39.22 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.75 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.76 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.76 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  42.86 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  38.98 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  42.04 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  37.66 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  36.81 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  38.89 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  38.73 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  38.26 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  37.89 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  40.54 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  42.31 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  41.98 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  42.64 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  36.42 
 
 		 219 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  39.1 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  42.74 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  38.65 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  38.73 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  42.31 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  36.84 
 
 		 221 aa  98.6  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  38.81 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.89 
 
 		 168 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  37.58 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  39.24 
 
 		 201 aa  97.8  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  34.97 
 
 		 184 aa  97.4  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  35.8 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  37.65 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>