More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1083 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  93.02 
 
 		 172 aa  336  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  43.04 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  41.77 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  40.51 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  39.87 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  42.58 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  41.51 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  39.87 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  40.88 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  39.24 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  38.69 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  39.29 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  39.24 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  39.74 
 
 		 179 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  38.61 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  38.71 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  37.97 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  37.34 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  38.61 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  37.34 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  37.04 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  38.06 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  41.55 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  40.38 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  38.95 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  39.24 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  36.91 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  37.82 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  38.36 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  38.36 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  37.11 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  39.62 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  36.97 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  37.11 
 
 		 179 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  36.08 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  36.65 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  38.12 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  36.14 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  38.01 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.42 
 
 		 164 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  35.71 
 
 		 177 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  34.76 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  36.54 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  42 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  39.31 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  36.36 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  39.35 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  40.38 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  37.35 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  39.19 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  34.97 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  37.89 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  34.57 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  36.88 
 
 		 176 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  33.54 
 
 		 183 aa  97.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  34.5 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  33.92 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  34.23 
 
 		 191 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  35.09 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  33.77 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  34.44 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  38.06 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  43.08 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  35.62 
 
 		 190 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  36.67 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  38.93 
 
 		 167 aa  94.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  36.42 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  35.58 
 
 		 186 aa  94  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  37.42 
 
 		 187 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  35.37 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  34.91 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  37.16 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  34.57 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  37.84 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  35.19 
 
 		 274 aa  93.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  34.29 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  37.84 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  37.25 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  34.36 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  36.67 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  36.31 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>