More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0651 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  72.35 
 
 		 177 aa  258  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  69.59 
 
 		 177 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  69.59 
 
 		 177 aa  254  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  69.59 
 
 		 177 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  66.29 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  68.82 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  66.86 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  65.71 
 
 		 177 aa  238  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  64 
 
 		 177 aa  238  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  65.29 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  64 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  66.67 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  67.25 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  66.28 
 
 		 186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  60.89 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  64.91 
 
 		 204 aa  230  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  67.26 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  64 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  64.33 
 
 		 174 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  65.12 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  66.07 
 
 		 177 aa  227  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  66.07 
 
 		 177 aa  227  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  66.07 
 
 		 177 aa  227  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  66.07 
 
 		 177 aa  227  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  66.07 
 
 		 177 aa  227  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  65.48 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  65.48 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  65.7 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  65.7 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  62.15 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  67.25 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  62.15 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  62.15 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  68.02 
 
 		 200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  61.58 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  61.02 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  66.85 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  61.18 
 
 		 178 aa  213  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  65.14 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  65.12 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  65.12 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  65.12 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  65.12 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  62.94 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  64.33 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  61.18 
 
 		 178 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  60.59 
 
 		 178 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  58.82 
 
 		 178 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  55.03 
 
 		 171 aa  191  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  51.2 
 
 		 181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  47.67 
 
 		 207 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  50.32 
 
 		 169 aa  154  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  44.05 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  39.88 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  38.16 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  39.07 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  42.69 
 
 		 178 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  39.86 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  36.84 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  39.07 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.57 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  35.71 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  35.71 
 
 		 178 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  37.97 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  38.46 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  39.47 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  36.65 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  38.16 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  43.04 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  41.36 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.4 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  34.62 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  41.03 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  35.5 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.16 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  39.75 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  38.89 
 
 		 192 aa  98.2  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  38.01 
 
 		 230 aa  98.2  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.16 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  36.99 
 
 		 181 aa  97.4  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  37.5 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  36.18 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  35 
 
 		 152 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  35.48 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  37.18 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  37.58 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  39.87 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  37.58 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  37.58 
 
 		 185 aa  95.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  37.74 
 
 		 155 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  37.58 
 
 		 185 aa  94.4  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  37.25 
 
 		 211 aa  94  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  94.4  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  39.49 
 
 		 154 aa  94  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  34.3 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.82 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  34.88 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  33.13 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>