More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3599 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  98.92 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  98.92 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  98.38 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  78.36 
 
 		 176 aa  263  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  75.88 
 
 		 181 aa  261  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  72.97 
 
 		 181 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  75.29 
 
 		 181 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  76.02 
 
 		 181 aa  252  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  58.55 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  62.18 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  56.17 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  54.3 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  51.28 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  49.4 
 
 		 178 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  49.4 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  48.1 
 
 		 181 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  50.66 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  45.75 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  47.4 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  42.68 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  48.09 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  39.43 
 
 		 178 aa  120  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  37.18 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  37.18 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  37.18 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40.94 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  40.94 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  44.08 
 
 		 177 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.18 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  35.44 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  33.99 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  42.11 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  34.81 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  33.99 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  45.16 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  38.16 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  35 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  33.97 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  38.79 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  39.61 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  33.33 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  35.44 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  41.1 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  38.22 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  32.73 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  32.3 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  39.07 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  38.18 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  40.38 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  38.67 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  37.42 
 
 		 201 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  45.97 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  35.53 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  39.07 
 
 		 171 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  34.42 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  40.69 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  35.96 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  34.64 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  45.16 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  36.94 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  34.62 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  30.64 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  41.45 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  34.81 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  34.87 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  36.84 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  39.74 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  34.87 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  37.75 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  34.62 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  39.31 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  35.92 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  32.93 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  37.58 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  32.74 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0149  peptide deformylase  44.8 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.213769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0873  N-formylmethionyl tRNA deformylase  45.67 
 
 		 163 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2533  peptide deformylase  45.67 
 
 		 163 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.123304  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  35.76 
 
 		 162 aa  95.1  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  39.73 
 
 		 177 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  29.12 
 
 		 194 aa  94.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  33.13 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  37.09 
 
 		 171 aa  94.4  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  37.01 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  38.51 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  43.9 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  34.15 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  32.21 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  37.91 
 
 		 213 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  34.48 
 
 		 154 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  33.55 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  36.99 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  36.09 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  32.89 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  32.89 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>