More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1062 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  84.53 
 
 		 181 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  84.53 
 
 		 181 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  85.14 
 
 		 176 aa  306  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  76.02 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  76.02 
 
 		 185 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  75.44 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  75.44 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  68.51 
 
 		 181 aa  244  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  58.94 
 
 		 168 aa  190  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  60.65 
 
 		 170 aa  184  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  54.27 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  52.5 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  50.62 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  50.62 
 
 		 178 aa  154  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  45.98 
 
 		 179 aa  150  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  46.11 
 
 		 181 aa  148  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  44.64 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  48.78 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  43.11 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  44.85 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  40.72 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.31 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  36.88 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  36.88 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40.79 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  34.48 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  37.27 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  35.98 
 
 		 190 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  33.72 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  37.27 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  43.45 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  33.91 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  34.73 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  34.42 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.06 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  34.42 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  34.38 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  35.62 
 
 		 203 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  34.87 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  40.94 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  37.25 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  33.13 
 
 		 188 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  34.97 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  37.74 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  36.42 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  35.1 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  37.25 
 
 		 201 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  40.12 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  33.54 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  35.58 
 
 		 192 aa  100  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  34.38 
 
 		 187 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  34.38 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  40 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  36.84 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  38.56 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  34.44 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  35.76 
 
 		 169 aa  99.4  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  35.93 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  38.95 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  34.97 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  38.22 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.24 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  42.07 
 
 		 177 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  42.76 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.24 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  33.13 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  35.57 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  36.67 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  35.9 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  34.73 
 
 		 153 aa  97.8  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  34.42 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  34.97 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  37.82 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0149  peptide deformylase  44.44 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.213769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  37.76 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  36.11 
 
 		 156 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  44.72 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  36.11 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  40.41 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  94.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  34.9 
 
 		 177 aa  94.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  32.72 
 
 		 162 aa  94.7  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  39.26 
 
 		 171 aa  94.4  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  35.15 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  34 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  35.26 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  36.81 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  43.09 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  30.95 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  37.11 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  41.78 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  35.62 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  42.15 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  42.52 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0873  N-formylmethionyl tRNA deformylase  43.75 
 
 		 163 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2533  peptide deformylase  43.75 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.123304  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  37.82 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2195  peptide deformylase  35.06 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.370127  normal  0.0393169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>