More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3037 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  97.79 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  84.53 
 
 		 181 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  86.21 
 
 		 176 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  74.57 
 
 		 185 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  75.88 
 
 		 185 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  75.29 
 
 		 185 aa  260  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  75.29 
 
 		 185 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  69.06 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  58.97 
 
 		 168 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  61.94 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  53.89 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  51.25 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  49.38 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  48.68 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  49.38 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  48.68 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  49.03 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  44.72 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  45.81 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  43.95 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  42.76 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  41.45 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40.27 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  46.94 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  35.53 
 
 		 187 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  34.5 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  40.27 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  35.03 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  35.03 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  34.21 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  34.21 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  33.74 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  33.33 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  41.33 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  35.8 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  41.96 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  43.45 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  35.76 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.06 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  33.13 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  32.53 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  33.74 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  34.87 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  37.66 
 
 		 201 aa  101  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  36.84 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  35.76 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  38.46 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  34.81 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  34.13 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  36.67 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  33.13 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  40.52 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  32.89 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  39.6 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  39.1 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  35.22 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  36.6 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0149  peptide deformylase  45.24 
 
 		 163 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.213769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  35.71 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  40.69 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  39.73 
 
 		 177 aa  98.2  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  34.19 
 
 		 187 aa  98.2  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  44.72 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  32.91 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  37.33 
 
 		 170 aa  97.8  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  44.22 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  42.25 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  40.88 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  36.81 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  34.97 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  38.93 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  43.09 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  33.94 
 
 		 188 aa  95.5  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  36.3 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  39.73 
 
 		 177 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  34.97 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  33.74 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  36.3 
 
 		 175 aa  94.7  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  36.3 
 
 		 175 aa  94.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  32.89 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  35.19 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  38.89 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  34.67 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  37.3 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  40.97 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  32.24 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  32.93 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0873  N-formylmethionyl tRNA deformylase  43.75 
 
 		 163 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  33.77 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  38.71 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  42.07 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2533  peptide deformylase  43.75 
 
 		 163 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.123304  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  39.1 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  42.07 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  32.18 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  43.45 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  37.93 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>