More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0639 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  100 
 
 		 174 aa  359  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  58.49 
 
 		 176 aa  190  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  57.89 
 
 		 170 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  53.89 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  56.17 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  53.89 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  55.56 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  55.56 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  54.94 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  54.27 
 
 		 181 aa  181  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  56 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  49.37 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  51.32 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  51.66 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  51.66 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  49.68 
 
 		 181 aa  154  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  49.03 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  47.85 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  44.37 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  47.02 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  42.58 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  45.81 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  38.71 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  38.71 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  39.33 
 
 		 175 aa  124  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40.51 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  37.41 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  37.41 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  37.41 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  36.42 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  36.42 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  34.18 
 
 		 202 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.15 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  34.81 
 
 		 202 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  44.03 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.1 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  34.18 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  37.42 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  40.94 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  41.06 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  41.56 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  35.8 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  39.51 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  35.62 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  35 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  41.94 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  37.06 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  42 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  35.22 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  40.91 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  33.33 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  44.68 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  37.97 
 
 		 240 aa  111  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  36.73 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  38.96 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  35.1 
 
 		 201 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  40.14 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  36.99 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  43.05 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  42.86 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  35.4 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  36.42 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  35.33 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  34.38 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  37.58 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  32.73 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  35.03 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.14 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.93 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  36.18 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  35.29 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  39.31 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  40.41 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  41.45 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  39.74 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.42 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  34.87 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  39.18 
 
 		 215 aa  107  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  37.09 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  41.5 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  35.98 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  39.13 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  36.24 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  41.45 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  34.39 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  37.82 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  41.22 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  34.87 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  36.97 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  34.39 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  41.22 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  34.42 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0149  peptide deformylase  43.24 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.213769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  37.67 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  43.97 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  40.38 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  38.82 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>