More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2184 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  68.59 
 
 		 195 aa  250  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  52.2 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  43.96 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  42.26 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  45.12 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.11 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  39.78 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  43.27 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.93 
 
 		 178 aa  118  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  45.06 
 
 		 189 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  41.88 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  41.52 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  39.31 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  42.69 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  42.6 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  40.7 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.17 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  43.67 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  40.45 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  40 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  38.42 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  41.28 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  41.72 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  41.46 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  42.61 
 
 		 164 aa  114  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.37 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  37.57 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  42.5 
 
 		 154 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  39.78 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  38.71 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  39.88 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  43.48 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  38.02 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.64 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  37.79 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  39.29 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  35.29 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  41.52 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  42.5 
 
 		 156 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  43.79 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  40.7 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  40 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  39.68 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  42.35 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  41.1 
 
 		 164 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.98 
 
 		 190 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  38.38 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  38.38 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  42.07 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  42.07 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.51 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  38.37 
 
 		 159 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  40.78 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  39.44 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.51 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  44.08 
 
 		 154 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  40.48 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  42.77 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  40.37 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  42.26 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  43.9 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  40.13 
 
 		 147 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  40.45 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  39.25 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  38.59 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  42.48 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.72 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  39.29 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  39.04 
 
 		 190 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  40 
 
 		 178 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0873  peptide deformylase  39.52 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.905426 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  42.24 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  41.36 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  39.26 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.12 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  40.74 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  37.5 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  45.51 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  41.46 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40.33 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  40.13 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  44.03 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  34.29 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  35.43 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  38.86 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  37.16 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  39.89 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.1 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  38.76 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  40.37 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  37.21 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  42.86 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  41.18 
 
 		 167 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  38.86 
 
 		 199 aa  104  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  43.95 
 
 		 164 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  37.1 
 
 		 181 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  41.18 
 
 		 167 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  41.24 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  40.49 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>