More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33985 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  100 
 
 
240 aa  497  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  42.58 
 
 
178 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  44 
 
 
164 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  42.67 
 
 
164 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  41.33 
 
 
174 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  43.33 
 
 
171 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.75 
 
 
170 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.75 
 
 
170 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  41.29 
 
 
170 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  42.67 
 
 
171 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  42.95 
 
 
180 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  45.45 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.78 
 
 
154 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  36.51 
 
 
201 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  42.67 
 
 
175 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  43.42 
 
 
187 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  43.42 
 
 
187 aa  118  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  41.25 
 
 
173 aa  118  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  38.67 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  39.73 
 
 
176 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  38.67 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  44.14 
 
 
169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  34.27 
 
 
201 aa  116  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  33.7 
 
 
201 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  33.7 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  39.74 
 
 
172 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  33.15 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  38.18 
 
 
188 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  39.02 
 
 
177 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  39.02 
 
 
177 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  36.47 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  33.89 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  32.81 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  34.54 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  39.6 
 
 
174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  42.67 
 
 
172 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  38.56 
 
 
187 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  38.93 
 
 
171 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  37.5 
 
 
168 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.5 
 
 
168 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  38.93 
 
 
171 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  37.5 
 
 
168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  37.5 
 
 
168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  40.27 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.12 
 
 
168 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  35.76 
 
 
177 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  44.22 
 
 
154 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  38.99 
 
 
167 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  39.26 
 
 
177 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  38.16 
 
 
201 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  38.93 
 
 
171 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  39.35 
 
 
173 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.38 
 
 
168 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  38.12 
 
 
168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  38.12 
 
 
168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  37.59 
 
 
180 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  38.37 
 
 
185 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0246  peptide deformylase  39.77 
 
 
196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  39.19 
 
 
176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  40.49 
 
 
178 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  38.36 
 
 
167 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  42.57 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  37.5 
 
 
168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  36.99 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  34.97 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  40.65 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  38.36 
 
 
167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  41.22 
 
 
178 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  38.99 
 
 
173 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  40.14 
 
 
157 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.75 
 
 
168 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  38.36 
 
 
167 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  40.65 
 
 
175 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  41.89 
 
 
156 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  36.25 
 
 
171 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  41.89 
 
 
156 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  41.89 
 
 
156 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  40.14 
 
 
171 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  41.1 
 
 
177 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  41.89 
 
 
156 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0873  peptide deformylase  40.46 
 
 
190 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.905426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  38.36 
 
 
167 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  41.61 
 
 
156 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  38.36 
 
 
167 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  33.92 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  38.36 
 
 
165 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  38.18 
 
 
167 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  38.82 
 
 
162 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  37.11 
 
 
181 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  40 
 
 
187 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  37.5 
 
 
168 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  37.97 
 
 
167 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  38.36 
 
 
179 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  38.67 
 
 
175 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  37.74 
 
 
168 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  37.82 
 
 
174 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  36.41 
 
 
199 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  41.22 
 
 
156 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  40 
 
 
175 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  38.51 
 
 
173 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>