More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0246 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0246  peptide deformylase  100 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  46.2 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  43.42 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  41.07 
 
 		 169 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  43.31 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.85 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  41.45 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  42.68 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  42.68 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  38.85 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  42.68 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  41.4 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  41.4 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  41.4 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  41.4 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  39.77 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  42.68 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  39.64 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  39.23 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  38.29 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  42.68 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  38.71 
 
 		 177 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.62 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  38.22 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  43.88 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  37.97 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  44.03 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  37.97 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  41.51 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  37.97 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  39.87 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  40.37 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  41.72 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  40.11 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  39.75 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  40.97 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  42.68 
 
 		 169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  36.36 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  40.11 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  43.88 
 
 		 147 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  42.33 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  35.29 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  42.33 
 
 		 168 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  39.18 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  39.77 
 
 		 240 aa  111  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  42.33 
 
 		 168 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.04 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  39.49 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  40.26 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.19 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  39.49 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.49 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  35.85 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  34.32 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  38.85 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  41.4 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  38.26 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  41.72 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.6 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  38.56 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  38.36 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  41.14 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  39.47 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  41.1 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  37.5 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  36.08 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  36.08 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  36.31 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  35.88 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  42.04 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  40.96 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  38.22 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  40.13 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  39.01 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  41.14 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  41.1 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  36.48 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  38.85 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  40.12 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  43.04 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  37.5 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  39.22 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  40.76 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  39.24 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>