More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3726 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  100 
 
 
167 aa  335  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  52.23 
 
 
164 aa  148  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  48.43 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  44.64 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  40.96 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  46 
 
 
164 aa  127  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  43.67 
 
 
181 aa  127  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  45 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  46 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  43.11 
 
 
188 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  42.21 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.14 
 
 
181 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  43.9 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  43.56 
 
 
153 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0873  peptide deformylase  47.24 
 
 
190 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.905426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  42.58 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  44.65 
 
 
181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  43.75 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  42.58 
 
 
187 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  44.44 
 
 
167 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  42.58 
 
 
187 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  44.44 
 
 
167 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  44.44 
 
 
167 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  45.83 
 
 
156 aa  117  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  43.75 
 
 
167 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40.51 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40.51 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  42.77 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  41.94 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  42.66 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  42.66 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40.51 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  43.75 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  40.12 
 
 
167 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  43.26 
 
 
187 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  41.14 
 
 
172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  45 
 
 
178 aa  114  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  42.07 
 
 
186 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  40.54 
 
 
187 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  42.95 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  42.95 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  42.31 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.51 
 
 
168 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  43.66 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  44.44 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  40.51 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40.51 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  39.6 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  41.78 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0833  peptide deformylase  42.33 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  37.43 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  41.29 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  37.74 
 
 
169 aa  112  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  40.51 
 
 
168 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  39.24 
 
 
168 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  39.6 
 
 
201 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  38.64 
 
 
193 aa  112  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  41.94 
 
 
189 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  40.69 
 
 
188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  38.93 
 
 
202 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  41.83 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  42.31 
 
 
204 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  40.74 
 
 
177 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  45.59 
 
 
167 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  41.06 
 
 
176 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  45.59 
 
 
167 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  46.27 
 
 
216 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  45.59 
 
 
179 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  41.03 
 
 
203 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  41.51 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  40.41 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  45.59 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  40.41 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  41.1 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  45.59 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  40.37 
 
 
170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  41.1 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  37.11 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  45.59 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  40.37 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  41.29 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  45.59 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40.88 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  44.52 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  38.62 
 
 
187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  39.38 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  41.84 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  38.12 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  42.36 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  39.75 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  44.08 
 
 
173 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  43.26 
 
 
168 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  38.86 
 
 
177 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  37.97 
 
 
240 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  41.77 
 
 
166 aa  107  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  37.89 
 
 
162 aa  107  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  42.36 
 
 
167 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  41.18 
 
 
177 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.89 
 
 
174 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  39.87 
 
 
168 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>