More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  100 
 
 		 162 aa  326  8e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  85.19 
 
 		 162 aa  281  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  82.1 
 
 		 162 aa  278  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  80.25 
 
 		 164 aa  261  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  77.16 
 
 		 162 aa  261  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  70.44 
 
 		 162 aa  222  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  66.05 
 
 		 162 aa  217  6e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  64.38 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  61.49 
 
 		 184 aa  197  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  59.01 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  59.76 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  58.49 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  53.42 
 
 		 180 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  52.2 
 
 		 188 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  53.42 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  54.66 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  49.07 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  50.93 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  49.69 
 
 		 186 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  50 
 
 		 168 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  50.93 
 
 		 182 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  47.83 
 
 		 186 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  51.55 
 
 		 181 aa  156  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  48.77 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  48.75 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  48.12 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  46.58 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  48.45 
 
 		 204 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  47.8 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  47.2 
 
 		 197 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  49.66 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  48.52 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  47.34 
 
 		 195 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  43.6 
 
 		 192 aa  134  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  47.56 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  40.2 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  43.53 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  44.63 
 
 		 197 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  46.07 
 
 		 197 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  46.07 
 
 		 197 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  46.07 
 
 		 197 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  44.63 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  44.63 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  43.9 
 
 		 182 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  44.08 
 
 		 185 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  43.11 
 
 		 230 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  46.94 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  39.87 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  40.48 
 
 		 213 aa  118  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  40.76 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  38.99 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.11 
 
 		 190 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  40.91 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  41.36 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  37.95 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  39.63 
 
 		 177 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  39.46 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  46.04 
 
 		 221 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  42.69 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  38.46 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  39.77 
 
 		 198 aa  110  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  38.32 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  34.55 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  38.32 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  34.55 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  34.55 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  43.29 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  36.97 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  37.35 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  38.1 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  39.1 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  37.89 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  40.44 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  34.94 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  34.76 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  38.78 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.67 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  35.77 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  39.51 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  38.26 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  37.87 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.26 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.58 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  36.81 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  37.8 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  37.13 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  36.75 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  41.26 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  38.78 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.31 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  34.94 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  38 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.13 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.13 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  36.14 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  36.48 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  38 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  40.41 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  38.6 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  34.52 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>