More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1868 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  91.4 
 
 		 186 aa  350  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  75.82 
 
 		 183 aa  284  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  66.48 
 
 		 181 aa  234  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  63.28 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  65.36 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  66.49 
 
 		 181 aa  230  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  64.2 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  65.73 
 
 		 182 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  60.96 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  63.69 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  61.29 
 
 		 181 aa  204  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  55.95 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  56.63 
 
 		 168 aa  184  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  50.89 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  50.27 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  50.61 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  50.92 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  53.37 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  55.06 
 
 		 161 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  61.02 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  53.09 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  50.94 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  47.83 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  56.16 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  48.73 
 
 		 164 aa  157  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  49.06 
 
 		 162 aa  156  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  45.28 
 
 		 162 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  51.01 
 
 		 162 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  43.75 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  45.57 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  44.3 
 
 		 162 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  41.77 
 
 		 162 aa  141  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  46.67 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  45.75 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  52.74 
 
 		 159 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  46.43 
 
 		 213 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.53 
 
 		 178 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  41.54 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  44.77 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  47.8 
 
 		 182 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  44.24 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  45.68 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  43.12 
 
 		 163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.56 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  42.21 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  40.91 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  46.5 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  40.5 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  40.5 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  40.5 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  41.08 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  41.83 
 
 		 156 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  39.6 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  39.6 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  43.45 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.45 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.08 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.08 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  40.72 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  39.11 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  43.8 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  38.41 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.38 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.14 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  44.2 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  40.4 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.25 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  44.52 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  39.19 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  43.75 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  40.91 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  42.21 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  42.07 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.18 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.41 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.41 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  41.22 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  39.2 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  36.79 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  39.51 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  43.03 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  41.61 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.78 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  42.07 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  41.98 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  39.87 
 
 		 158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40.56 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  42.76 
 
 		 155 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  42.77 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  39.73 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  45.22 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  41.56 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  42.86 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  42.86 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  42.86 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  42.86 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.91 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  43.24 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>