More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  100 
 
 		 163 aa  327  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  65.24 
 
 		 162 aa  204  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  61.96 
 
 		 164 aa  201  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  61.59 
 
 		 162 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  59.51 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  59.76 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  57.76 
 
 		 161 aa  178  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  56.88 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  56.1 
 
 		 162 aa  176  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  54.6 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  54.32 
 
 		 184 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  51.88 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  49.69 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  48.45 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  44.44 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  47.53 
 
 		 180 aa  143  9e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  43.83 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  45.62 
 
 		 188 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  45.06 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  44.1 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  47.53 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  43.21 
 
 		 186 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  45.68 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  43.12 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  43.83 
 
 		 182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  47.24 
 
 		 204 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  44.19 
 
 		 197 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  42.11 
 
 		 192 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  43.83 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  41.48 
 
 		 197 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  46.01 
 
 		 197 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  39.77 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  42.05 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  42.05 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  42.05 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  44.44 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  43.56 
 
 		 178 aa  120  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  40.48 
 
 		 213 aa  120  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  41.46 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  38.24 
 
 		 230 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  39.88 
 
 		 195 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  45.27 
 
 		 191 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  41.82 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  41.98 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  45.95 
 
 		 177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  40.57 
 
 		 198 aa  114  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  35.88 
 
 		 190 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  40.49 
 
 		 200 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  40.59 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.89 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  38.27 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  36.77 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  36.08 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  36.42 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  36.42 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  39.75 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  37.65 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  38.12 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.82 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  39.19 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  38.16 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.42 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  37.95 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  35.19 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  37.72 
 
 		 230 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  37.93 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  37.74 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  37.34 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  37.2 
 
 		 170 aa  97.4  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  37.2 
 
 		 170 aa  97.4  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  34.59 
 
 		 172 aa  97.4  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  32.93 
 
 		 176 aa  97.4  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  38.99 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  33.33 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  34.94 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  35.8 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  37.93 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  38.22 
 
 		 227 aa  96.3  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  37.04 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  34.15 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  29.88 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  29.88 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  41.78 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  34.57 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  41.78 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  39.35 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  36.14 
 
 		 167 aa  94  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  33.95 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  33.54 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  33.73 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  37.5 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  39.1 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  33.95 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  33.11 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  33.95 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  34.13 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  35.4 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  35.85 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  36.71 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  34.59 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>