More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26070 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  100 
 
 		 192 aa  393  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  59.79 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  56.38 
 
 		 195 aa  208  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  56.9 
 
 		 183 aa  204  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  55.43 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  54.19 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  54.75 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  54.75 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  51.85 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  51.85 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  51.85 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  50.79 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  54.76 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  54.6 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  51.15 
 
 		 190 aa  164  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  51.15 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  48.89 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  50 
 
 		 221 aa  151  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  44.69 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  48 
 
 		 230 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  51.85 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  42.46 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  50 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  43.93 
 
 		 162 aa  141  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  44.89 
 
 		 204 aa  140  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  51.22 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  43.43 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  43.6 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  43.93 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  44.51 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  45.51 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  43.6 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  45.86 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  45.61 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  43.5 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  46.02 
 
 		 219 aa  131  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  46.15 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  42.29 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  45.18 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  42.11 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  40.91 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  39.71 
 
 		 230 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  39.39 
 
 		 162 aa  128  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  44.51 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  40.91 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  42.11 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  44.32 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  41.95 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  45.06 
 
 		 173 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  40.23 
 
 		 181 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  47.67 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  38.22 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  49.04 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  39.66 
 
 		 166 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  38.86 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  38.3 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  39.43 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  39.88 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  43.67 
 
 		 167 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  39.6 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  38.37 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  39.08 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  38.37 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  38.37 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  37.29 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  38.37 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  38.37 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  37.23 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  35.86 
 
 		 179 aa  115  5e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  42.68 
 
 		 162 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  39.66 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  36.14 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  38.33 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  37.79 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.76 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.76 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  37.79 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  43.04 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  37.79 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  37.79 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  37.79 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  37.79 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  37.79 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  46.48 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  37.79 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  37.79 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  37.79 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  38.76 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  35.84 
 
 		 169 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  45.77 
 
 		 164 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.99 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.99 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  40.61 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  40.61 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  37.14 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  38.12 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  36.84 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  36.05 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  37.43 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  37.14 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>