More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0427 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  100 
 
 
195 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  76.24 
 
 
183 aa  295  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  67.17 
 
 
198 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  63.68 
 
 
190 aa  260  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  65.64 
 
 
197 aa  258  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  66.15 
 
 
197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  66.15 
 
 
197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  66.15 
 
 
197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  64.1 
 
 
197 aa  251  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  63.08 
 
 
197 aa  245  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  64 
 
 
200 aa  232  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  57.98 
 
 
190 aa  216  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  57.98 
 
 
190 aa  209  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  56.38 
 
 
192 aa  208  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  59.24 
 
 
213 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  51.52 
 
 
215 aa  185  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  45.88 
 
 
213 aa  171  9e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  50.82 
 
 
188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  57.05 
 
 
182 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  54.17 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  48.26 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  51.65 
 
 
200 aa  161  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  51.5 
 
 
230 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  54.07 
 
 
219 aa  156  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  50.29 
 
 
180 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  44.79 
 
 
186 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  47.73 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  43.75 
 
 
186 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  48.88 
 
 
182 aa  147  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  52.23 
 
 
199 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  53.74 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  47.67 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  46.82 
 
 
167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  49.68 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  48.21 
 
 
204 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  45.26 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.76 
 
 
178 aa  144  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  54.84 
 
 
191 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  52.26 
 
 
164 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  47.02 
 
 
162 aa  140  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  44.97 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  46.51 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  42.33 
 
 
188 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  47.09 
 
 
181 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  41.87 
 
 
230 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  46.43 
 
 
162 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  44.19 
 
 
181 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  53.02 
 
 
227 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  43.6 
 
 
183 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  47.34 
 
 
162 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  44.71 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  45.93 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  46.43 
 
 
162 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  47.27 
 
 
162 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  43.39 
 
 
185 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  45.35 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  43.02 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  41.18 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  42.44 
 
 
181 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  39.41 
 
 
162 aa  118  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.12 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  39.88 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  43.59 
 
 
157 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  40.12 
 
 
180 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  40.49 
 
 
164 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  40.26 
 
 
147 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  40.26 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  41.32 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  42.14 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.64 
 
 
170 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.64 
 
 
170 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.89 
 
 
187 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.89 
 
 
187 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  38.04 
 
 
153 aa  110  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  41.82 
 
 
159 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  40 
 
 
171 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  42.33 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  39.18 
 
 
168 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  36.87 
 
 
175 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  43.32 
 
 
177 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  41.88 
 
 
167 aa  108  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  41.32 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  36.67 
 
 
174 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.32 
 
 
185 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.37 
 
 
168 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.26 
 
 
164 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.29 
 
 
174 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  38.6 
 
 
168 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.32 
 
 
185 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  39.53 
 
 
177 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  38.73 
 
 
170 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  44.23 
 
 
177 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  40.27 
 
 
180 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  42.14 
 
 
173 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  38.01 
 
 
169 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  40.12 
 
 
185 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  36.99 
 
 
187 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  35.5 
 
 
169 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  38.6 
 
 
168 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  38.6 
 
 
168 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>