More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5192 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  65.92 
 
 		 182 aa  227  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  62.84 
 
 		 221 aa  224  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  62.01 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  59.34 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  60.92 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  62.5 
 
 		 183 aa  198  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  60.71 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  58.82 
 
 		 173 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  59.24 
 
 		 195 aa  188  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  55.49 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  58.93 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  51.58 
 
 		 192 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  53.66 
 
 		 190 aa  167  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  50.29 
 
 		 190 aa  161  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  51.88 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  57.41 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  53.61 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  52.12 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  47.94 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  48.8 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  53.33 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  50.6 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  53.05 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  53.05 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  45.85 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  53.05 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  49.72 
 
 		 168 aa  147  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  47.53 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  47.53 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  50.6 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  51.25 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  46.99 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  48.43 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  52.12 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  45.95 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  48.43 
 
 		 162 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  44.38 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  47.8 
 
 		 162 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  49.11 
 
 		 162 aa  141  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  46.37 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  50.61 
 
 		 162 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  45.62 
 
 		 181 aa  138  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  44.69 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  40.68 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  40.68 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  43.02 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  47.2 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  45.78 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  48.07 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  45.78 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  50 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  42.44 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  42.53 
 
 		 174 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  46.58 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  42.62 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  52.63 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  45.62 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  42.07 
 
 		 162 aa  128  8.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40.11 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.9 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  43.48 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  45.56 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  38.95 
 
 		 171 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  42.7 
 
 		 182 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  37.79 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  42.33 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  42.62 
 
 		 188 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.95 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  37.81 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.1 
 
 		 168 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  42.77 
 
 		 179 aa  122  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  41.72 
 
 		 168 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  41.72 
 
 		 168 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.37 
 
 		 170 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.37 
 
 		 170 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  38.51 
 
 		 185 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  40.36 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  40.36 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  41.51 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  38.5 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.85 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  41.34 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  40.36 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  43.98 
 
 		 157 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  38.65 
 
 		 167 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  42.68 
 
 		 163 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  41.51 
 
 		 179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  38.6 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  41.51 
 
 		 179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  41.51 
 
 		 167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.29 
 
 		 174 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  43.41 
 
 		 181 aa  118  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  38.99 
 
 		 167 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  38.82 
 
 		 180 aa  118  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  38 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  36.78 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.26 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  39.13 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  38.32 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>