More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2158 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  100 
 
 		 162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  87.04 
 
 		 162 aa  291  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  85.19 
 
 		 162 aa  281  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  76.54 
 
 		 162 aa  256  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  80.25 
 
 		 164 aa  254  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  67.7 
 
 		 162 aa  213  8e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  62.96 
 
 		 162 aa  206  9e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  64.15 
 
 		 184 aa  205  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  65.24 
 
 		 163 aa  204  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  62.26 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  61.01 
 
 		 166 aa  196  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  62.11 
 
 		 161 aa  194  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  55.35 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  54.37 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  52.5 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  50 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  51.88 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  54.04 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  52.83 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  50.94 
 
 		 186 aa  163  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  52.5 
 
 		 182 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  50.93 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  53.42 
 
 		 181 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  52.8 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  49.38 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  49.69 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  50 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  52.5 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  48.43 
 
 		 213 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  47.02 
 
 		 195 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  50.92 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  45.88 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  45 
 
 		 180 aa  137  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  44.51 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  45.51 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  49.66 
 
 		 191 aa  134  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  47.46 
 
 		 197 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  47.46 
 
 		 197 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  47.46 
 
 		 197 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  48.26 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  46.07 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  41.18 
 
 		 230 aa  130  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  45.51 
 
 		 197 aa  130  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.21 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  44.85 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  45.62 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  49.38 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  41.61 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  44.89 
 
 		 198 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  43.45 
 
 		 230 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  41.51 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  41.18 
 
 		 213 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  45.35 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  46.34 
 
 		 200 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  40.13 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  40.82 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  42.42 
 
 		 221 aa  114  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  36.59 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  37.5 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  41.67 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  41.72 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  42.41 
 
 		 200 aa  111  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  40.91 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  41.38 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.24 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  40.82 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  39.73 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  37.89 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  36.09 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  37.33 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  41.29 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  39.13 
 
 		 199 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  40 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  39.07 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  38.36 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  35.37 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  36.75 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  39.87 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  38 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  36.97 
 
 		 177 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  36.5 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  38.31 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  38.67 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  38 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  41.96 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  36.36 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  38.16 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.26 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  39.74 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.25 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  36.84 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  37.42 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  38 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  36.14 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.58 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  38 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  38 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  36.75 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  37.58 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>