More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2568 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  60.74 
 
 		 181 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  55.15 
 
 		 183 aa  188  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  55.95 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  55.95 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  50.29 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  55.83 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  54.32 
 
 		 180 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  53.89 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  55.56 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  56.79 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  52.47 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  52.1 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  55.83 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  51.9 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  50 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  47.24 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  50.31 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  50.31 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  46.58 
 
 		 162 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  44.72 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  42.93 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  45.91 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  45.91 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  41.72 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  52.05 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  40.09 
 
 		 230 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  46.3 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  45 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  52.44 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  56.17 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  44.87 
 
 		 164 aa  134  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  43.4 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.88 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  44.14 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  43.23 
 
 		 162 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  44.22 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  40 
 
 		 171 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  41.98 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  44.13 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  43.58 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  43.54 
 
 		 156 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.77 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  42.44 
 
 		 183 aa  120  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  44.32 
 
 		 215 aa  120  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  45.64 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  43.79 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  45.75 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  45.1 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  42.77 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  43.92 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  40.74 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.48 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.44 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  43.87 
 
 		 190 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  40.99 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  41.25 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  40.83 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  46.06 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  43.12 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  40.12 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  39.08 
 
 		 192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  41.98 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  40.7 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  41.29 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  39.16 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  41.88 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  41.34 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  43.05 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  40.65 
 
 		 170 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  35.54 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  41.29 
 
 		 171 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  41.11 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  38.04 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  41.11 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  41.11 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  45.86 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  41.38 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  38.55 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  40 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  42.07 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  44.9 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  39.31 
 
 		 152 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  39.58 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  41.52 
 
 		 200 aa  111  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  40.12 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  39.26 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.82 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  41.98 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  39.78 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  39.51 
 
 		 168 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  40.37 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  40.61 
 
 		 171 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  39.51 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  37.95 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  40.12 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  41.4 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  39.02 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  39.02 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  40.65 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>