More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4914 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  100 
 
 		 190 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  63.68 
 
 		 195 aa  260  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  63.96 
 
 		 197 aa  260  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  66.48 
 
 		 183 aa  259  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  61.93 
 
 		 197 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  60.91 
 
 		 197 aa  249  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  62.44 
 
 		 197 aa  244  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  62.44 
 
 		 197 aa  244  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  62.44 
 
 		 197 aa  244  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  60.71 
 
 		 198 aa  240  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  62.12 
 
 		 200 aa  229  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  55.5 
 
 		 190 aa  221  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  54.97 
 
 		 190 aa  214  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  55.43 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  48.48 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  55.76 
 
 		 221 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  51.18 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  49.21 
 
 		 213 aa  174  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  51.63 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  53.66 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  50.29 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  49.41 
 
 		 225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  49.43 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  51.83 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  47.62 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  47.09 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  46.24 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  46.59 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  47.95 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  47.13 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  49.07 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  48.55 
 
 		 173 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  48.26 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  40.93 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  45.66 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  45.88 
 
 		 162 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  46.51 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  43.02 
 
 		 181 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  41.54 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  43.18 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  47.67 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  45.56 
 
 		 164 aa  135  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  45.29 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  45.66 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  43.53 
 
 		 162 aa  131  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  45.61 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  43.53 
 
 		 162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  48.54 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  43.45 
 
 		 162 aa  129  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  40.98 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  43.02 
 
 		 181 aa  127  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  41.07 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  46.11 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  41.67 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  43.02 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  44.44 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  43.35 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  43.31 
 
 		 191 aa  121  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  41.38 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  42.68 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  46.5 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  44.77 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  40.7 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  44.59 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  44.59 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  45.81 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  44.65 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  39.13 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  42.95 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  42.5 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  42.77 
 
 		 171 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  45.16 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  43.12 
 
 		 177 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  45.16 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  42.5 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  42.5 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  42.5 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  42.5 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  42.59 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  43.12 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  42.5 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  43.12 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  41.88 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  41.88 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  41.88 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  44.65 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  41.51 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.29 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.29 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  40.37 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0906  peptide deformylase  36.77 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000931901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  39.87 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  39.26 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  41.98 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.65 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  43.31 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  39.18 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  43.12 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.65 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  36.97 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>