More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0402 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  62.5 
 
 		 182 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  60.71 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  60.69 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  57.63 
 
 		 173 aa  188  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  54.76 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  53.59 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  51.65 
 
 		 195 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  52.1 
 
 		 230 aa  160  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  49.47 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  53.85 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  47.95 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  51.85 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  50.28 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  50.28 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  47.9 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  46.67 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  47.22 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  52.76 
 
 		 197 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  47.28 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  45.45 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  51.53 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  49.38 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  49.38 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  44.65 
 
 		 183 aa  131  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  49.38 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  50 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  52.9 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  48.17 
 
 		 162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  50 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  47.73 
 
 		 167 aa  128  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  43.64 
 
 		 181 aa  128  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  44.24 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  44.38 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  45.29 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  48.04 
 
 		 168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  47.1 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  44.94 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  49.04 
 
 		 190 aa  125  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  49.73 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  48.15 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  40.32 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.71 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  40.91 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  44.13 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  41.18 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  41.46 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  47.1 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.69 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  39.88 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  40.45 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  36.25 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  40.96 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  35.98 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  41.34 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  44.3 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  44.3 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  40.37 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.74 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  43.5 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  42.5 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  41.06 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.94 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  42.86 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.07 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  40.99 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  40.61 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  36.97 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  41.29 
 
 		 157 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  41.52 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  40.37 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  42.41 
 
 		 162 aa  111  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  34.15 
 
 		 172 aa  111  9e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  39.38 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  37.8 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  42.77 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  41.94 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.97 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.97 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  39.31 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  42.86 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  46.78 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  36.36 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  38.51 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  40 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  40 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  40.83 
 
 		 159 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  43.54 
 
 		 168 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  39.75 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.75 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  38.51 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  38.51 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  40.24 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.38 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  36.36 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.38 
 
 		 168 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>