More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1818 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  86.03 
 
 		 179 aa  325  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  76.88 
 
 		 186 aa  279  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  75.98 
 
 		 179 aa  278  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  75.98 
 
 		 179 aa  278  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  73.74 
 
 		 186 aa  277  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  77.09 
 
 		 179 aa  275  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  77.09 
 
 		 179 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  74.01 
 
 		 177 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  72.88 
 
 		 177 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  72.88 
 
 		 177 aa  264  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  70.62 
 
 		 177 aa  256  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  70.06 
 
 		 177 aa  254  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  70.22 
 
 		 177 aa  254  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  250  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  69.49 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  69.49 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  69.49 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  69.49 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  69.49 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  66.67 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  73.18 
 
 		 178 aa  247  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  71.51 
 
 		 200 aa  245  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  66.1 
 
 		 177 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  66.29 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  68.16 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  66.85 
 
 		 178 aa  240  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  66.29 
 
 		 178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  64.04 
 
 		 177 aa  237  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  66.48 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  65.17 
 
 		 178 aa  236  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  64.25 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  62.86 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  63.69 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  67.25 
 
 		 177 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  65.92 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  64.16 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  66.67 
 
 		 177 aa  227  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  66.1 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  66.1 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  66.1 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  66.1 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  62.29 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  64.53 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  58.68 
 
 		 171 aa  204  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  48.77 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  45.61 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  42.53 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  44.91 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  39.24 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  36.57 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  40.49 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  37.75 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  39.1 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  44.22 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  37.82 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  38.56 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  40.69 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  43.67 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  42.59 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  40.4 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  34.81 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  41.18 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  44.16 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  39.35 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  35.71 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  40.88 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  43.23 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  44.16 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  35.71 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.71 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  43.31 
 
 		 204 aa  104  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.94 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  41.48 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  40.52 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  42.58 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  42.68 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  41.36 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  42.58 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  41.32 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  43.23 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  41.94 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  35.95 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  35.95 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  35.95 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  35.95 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  35.95 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  35.95 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  35.95 
 
 		 169 aa  101  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  35.95 
 
 		 169 aa  101  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>