More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3241 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  100 
 
 		 170 aa  348  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  63.23 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  62.18 
 
 		 185 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  62.18 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  61.94 
 
 		 181 aa  190  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  61.54 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  61.54 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  61.94 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  57.59 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  61.04 
 
 		 181 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  60.65 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  57.89 
 
 		 174 aa  177  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  47.93 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  50.98 
 
 		 178 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  50.65 
 
 		 178 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  48.05 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  48.12 
 
 		 188 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  46.36 
 
 		 181 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  48.34 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  49.67 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  45.45 
 
 		 182 aa  140  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  47.4 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  37.66 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  43.31 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  43.87 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  37.66 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  43.23 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  40.13 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  45.58 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  39.61 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  42.14 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  42.14 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  41.67 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  42.77 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  38.75 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  38.85 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  44.22 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  38.06 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  38.06 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  39.24 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  38.6 
 
 		 177 aa  110  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  39.38 
 
 		 204 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  37.66 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  37.01 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  37.01 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  39.38 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  41.67 
 
 		 186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  37.87 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  35.95 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  37.87 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  40.14 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  40.14 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  40.14 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  38.75 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  40.14 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  39.87 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  40.14 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  40.14 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  40.14 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  37.13 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  36.13 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  38.46 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  38.06 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  38.61 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  39.46 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  38.75 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  36.65 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  34.84 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  44.3 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  36.77 
 
 		 192 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  39.22 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  35.44 
 
 		 201 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  33.96 
 
 		 188 aa  103  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  40.26 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  43.84 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  35.33 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  35.71 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  35.58 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  37.01 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  34.64 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  34.81 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  33.55 
 
 		 201 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  33.74 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  38.22 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0873  N-formylmethionyl tRNA deformylase  43.85 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  34.78 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  41.03 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  41.22 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  35.48 
 
 		 189 aa  99.4  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0149  peptide deformylase  43.65 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.213769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  39.1 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2533  peptide deformylase  43.85 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.123304  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  33.73 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  36.88 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  39.1 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  37.18 
 
 		 178 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  35.1 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>