More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1477 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  66.28 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  64 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  65.7 
 
 		 177 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  64.53 
 
 		 177 aa  238  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  65.12 
 
 		 177 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  64.53 
 
 		 177 aa  237  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  64.53 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  64.53 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  63.95 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  62.86 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  61.63 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  61.49 
 
 		 204 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  60.89 
 
 		 177 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  63.95 
 
 		 177 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  61.8 
 
 		 186 aa  229  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  62.86 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  62.86 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  60.47 
 
 		 178 aa  227  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  63.95 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  59.88 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  60.45 
 
 		 177 aa  224  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  59.43 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  64.29 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  60.47 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  60.57 
 
 		 174 aa  221  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  59.3 
 
 		 178 aa  221  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  59.88 
 
 		 178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  64.57 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  59.3 
 
 		 177 aa  220  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  59.3 
 
 		 177 aa  220  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  59.3 
 
 		 177 aa  220  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  59.3 
 
 		 177 aa  220  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  59.3 
 
 		 177 aa  220  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  58.72 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  61.8 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  59.3 
 
 		 177 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  58.72 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  58.72 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  58.72 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  57.56 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  55.75 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  61.71 
 
 		 200 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  60.57 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  60.57 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  60.57 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  59.88 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  61.49 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  59.3 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  54.17 
 
 		 171 aa  187  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  50.88 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  45.14 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  48.21 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  42.29 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  43.23 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  41.11 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  42.58 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  42.86 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  42.69 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  42.14 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  42.86 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  41.56 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  39.1 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  40.91 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  36.26 
 
 		 209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  37.58 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  42.21 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  40.26 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  42.21 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  41.56 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  41.94 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  35.98 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  44.16 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  39.38 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  41.56 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  38.16 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0407  peptide deformylase  41.29 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447377  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  38.06 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  39.61 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  44.16 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  43.87 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2142  peptide deformylase  41.94 
 
 		 163 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.644494 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  41.94 
 
 		 163 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  36.08 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  39.61 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  41.94 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  43.23 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  38.96 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  40.91 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  40.26 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  41.29 
 
 		 163 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.11 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  40.65 
 
 		 163 aa  104  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  36.77 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  36.77 
 
 		 169 aa  104  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  36.77 
 
 		 169 aa  104  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  36.77 
 
 		 169 aa  104  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  36.77 
 
 		 169 aa  104  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  36.77 
 
 		 169 aa  104  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>