More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3284 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  100 
 
 		 176 aa  350  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  56.65 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  51.15 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  54.37 
 
 		 169 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  47.24 
 
 		 177 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  47.85 
 
 		 177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  47.56 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  44.91 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  46.63 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  47.85 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  47.53 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  46.01 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  47.02 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  45.4 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  47.85 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  45.73 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  45.68 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  45.68 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  45.68 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  45.68 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  45.68 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  45.68 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  45.68 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  45.29 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  44.05 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  48.19 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  46.11 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  46.63 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  44.79 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  46.01 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  48.19 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  45.4 
 
 		 177 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  45.4 
 
 		 177 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  45.4 
 
 		 177 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  44.91 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  44.91 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  44.05 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  45.4 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  45.51 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  45.51 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  42.51 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  45.18 
 
 		 179 aa  127  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  42.53 
 
 		 179 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  44.24 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  41.11 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  41.11 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  43.03 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  42.42 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  42.42 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  43.9 
 
 		 179 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  43.21 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  44.91 
 
 		 178 aa  121  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  42.42 
 
 		 200 aa  120  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  42.44 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  42.07 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  39.6 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  45.1 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  44.44 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  40.24 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  45.86 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  43.1 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  44.59 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  45.12 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  38.24 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  38.82 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  38.99 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  38.64 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  39.87 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  37.28 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  41.1 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  41.11 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  45.86 
 
 		 197 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  43.29 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  42.14 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  43.23 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  35.98 
 
 		 181 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  39.56 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  40.85 
 
 		 208 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  42.68 
 
 		 227 aa  104  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  39.88 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  39.77 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  47.97 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  43.75 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  42.58 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  40.88 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  36.88 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  42.95 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  36.59 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  38.36 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.89 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.94 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  42.68 
 
 		 200 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  37.5 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45.06 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  40.12 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.22 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  39.16 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  42.68 
 
 		 193 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  41.4 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  40.27 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>