More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3102 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  77.09 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  77.09 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  72.07 
 
 		 179 aa  268  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  73.74 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  71.51 
 
 		 179 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  251  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  250  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  69.83 
 
 		 179 aa  247  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  66.67 
 
 		 177 aa  244  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  66.67 
 
 		 177 aa  244  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  67.8 
 
 		 177 aa  242  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  68.54 
 
 		 177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  68.82 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  66.67 
 
 		 177 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  71.51 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  67.04 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  70.39 
 
 		 178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  67.04 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  62.92 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  64.41 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  68.02 
 
 		 177 aa  232  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  64.04 
 
 		 178 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  65.73 
 
 		 178 aa  230  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  65.9 
 
 		 174 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  64.04 
 
 		 178 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  65.54 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  65.54 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  65.54 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  65.54 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  65.54 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  64.61 
 
 		 178 aa  227  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  64.25 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  61.71 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  64.97 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  64.97 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  61.58 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  64.61 
 
 		 177 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  63.84 
 
 		 177 aa  224  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  60.45 
 
 		 177 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  63.13 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  62.57 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  61.58 
 
 		 177 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  62.15 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  61.58 
 
 		 177 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  61.58 
 
 		 177 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  61.58 
 
 		 177 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  58.48 
 
 		 171 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  50.89 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  47.95 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  48.48 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  41.04 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  42.48 
 
 		 190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  42.42 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  38.06 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  39.62 
 
 		 172 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  43.79 
 
 		 178 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  39.74 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  38.31 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.86 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  39.22 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  37.5 
 
 		 181 aa  111  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  43.29 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  39.78 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  36.36 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  39.19 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  43.4 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  36.36 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.95 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.95 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  40 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.83 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  39.61 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  39.87 
 
 		 152 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  48.74 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  42.21 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  40.8 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  41.22 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  39.22 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  40.91 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  38.31 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  42.86 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  38.27 
 
 		 150 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  40.91 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.56 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.68 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.27 
 
 		 168 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  41.18 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  37.66 
 
 		 169 aa  101  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  37.66 
 
 		 169 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  42.95 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  37.66 
 
 		 169 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  37.66 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  37.66 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  37.66 
 
 		 169 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>