More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1466 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  100 
 
 
177 aa  362  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  72.35 
 
 
177 aa  258  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  67.65 
 
 
177 aa  250  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  67.86 
 
 
177 aa  248  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  67.65 
 
 
177 aa  248  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  67.86 
 
 
177 aa  248  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  66.47 
 
 
177 aa  248  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  64.97 
 
 
177 aa  246  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  66.1 
 
 
177 aa  245  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  65.17 
 
 
179 aa  244  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  64 
 
 
177 aa  244  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  63.43 
 
 
177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  65.88 
 
 
177 aa  241  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  64.04 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  62.29 
 
 
177 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  63.07 
 
 
204 aa  236  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  62.86 
 
 
177 aa  236  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  61.71 
 
 
177 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  61.71 
 
 
177 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  61.71 
 
 
177 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  61.71 
 
 
177 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  61.71 
 
 
177 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  63.69 
 
 
179 aa  235  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  63.69 
 
 
179 aa  235  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  61.14 
 
 
177 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  62.35 
 
 
177 aa  234  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  61.14 
 
 
177 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  62.92 
 
 
186 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  64.97 
 
 
178 aa  229  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  63.53 
 
 
174 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  64.61 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  64.61 
 
 
179 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  62.86 
 
 
177 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  58.76 
 
 
178 aa  220  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  59.32 
 
 
178 aa  220  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  61.14 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  61.14 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  61.14 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  57.06 
 
 
178 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  62.92 
 
 
200 aa  216  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  62.35 
 
 
177 aa  216  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  57.06 
 
 
178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  62.22 
 
 
186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  55.75 
 
 
181 aa  214  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  59.3 
 
 
179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  57.56 
 
 
179 aa  207  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  58.14 
 
 
179 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  58.14 
 
 
179 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  56.4 
 
 
179 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  53.71 
 
 
181 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  49.4 
 
 
171 aa  180  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  54.49 
 
 
169 aa  167  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  48.84 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  44.91 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  44.97 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  42.86 
 
 
179 aa  137  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  40.51 
 
 
172 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  43.71 
 
 
176 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  41.29 
 
 
172 aa  131  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  39.24 
 
 
181 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  38.56 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  46.25 
 
 
181 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  38.56 
 
 
178 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  39.07 
 
 
190 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  41.22 
 
 
182 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  42.6 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  41.76 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  41.67 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.46 
 
 
164 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  43.75 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  43.12 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  37.5 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  43.59 
 
 
230 aa  114  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  39.38 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  41.25 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  42.47 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  39.38 
 
 
161 aa  111  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  35.9 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  37.91 
 
 
274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  45.51 
 
 
168 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  36.02 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  44.59 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  40 
 
 
204 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.13 
 
 
167 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  40.52 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  42.59 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  37.25 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.67 
 
 
181 aa  106  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  38.46 
 
 
170 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  40.37 
 
 
190 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  42.21 
 
 
167 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.45 
 
 
154 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  41.03 
 
 
181 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  40.12 
 
 
190 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  41.26 
 
 
165 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  41.67 
 
 
182 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.47 
 
 
167 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  43.64 
 
 
181 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  40.49 
 
 
190 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  42.59 
 
 
195 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>