More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1468 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  100 
 
 		 164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  48.08 
 
 		 183 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  52.23 
 
 		 167 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  44.72 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  48.05 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  50.34 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  46.41 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  45.75 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  44.16 
 
 		 181 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  49.66 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  47.17 
 
 		 181 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  46.75 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  44.81 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  44.87 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  46.15 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  41.4 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  44.44 
 
 		 188 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  44.67 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  44.03 
 
 		 182 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  41.56 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  41.56 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  44.74 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  39.18 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  45.81 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  45.03 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  43.48 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  43.21 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  44.67 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  48.23 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  44.52 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  45 
 
 		 213 aa  127  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  44.65 
 
 		 183 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  43.33 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  43.33 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  45 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  42.04 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  51.08 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  45.83 
 
 		 215 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  44.23 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  43.56 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  41.67 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  42.67 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  42.31 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  42.21 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  45.27 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  45.62 
 
 		 230 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  42.41 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  41.45 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  40.25 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  48.61 
 
 		 191 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  41.94 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  47.62 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  41.38 
 
 		 197 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  41.38 
 
 		 197 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  41.38 
 
 		 197 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  39.18 
 
 		 192 aa  121  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  45.45 
 
 		 240 aa  120  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  40.94 
 
 		 187 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  42.76 
 
 		 168 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  40.94 
 
 		 187 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  45.21 
 
 		 178 aa  120  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  43.71 
 
 		 200 aa  120  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  41.22 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  41.45 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  39.87 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  41.29 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  45.51 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  41.61 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  43.4 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  40.49 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  42 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  39.1 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  44.74 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  40.82 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  42.04 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  42.76 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  41.28 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  42.17 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  39.62 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  41.38 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  43.62 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  37.89 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  45.91 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  42.76 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  44.74 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  38.32 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  40.88 
 
 		 202 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.45 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  39.77 
 
 		 188 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  38.85 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  43.71 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  40.88 
 
 		 202 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.27 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  40.54 
 
 		 201 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  42.26 
 
 		 197 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45.12 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0868  peptide deformylase  38.65 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.184037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  40.49 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>