More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3885 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  58.82 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  57.63 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  60.23 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  57.4 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  56.21 
 
 		 230 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  53.53 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  53.89 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  56.05 
 
 		 225 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  55.19 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  50.31 
 
 		 199 aa  151  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  49.1 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  47.67 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  48.55 
 
 		 190 aa  144  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  49.07 
 
 		 227 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  45.24 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  45.68 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  45.62 
 
 		 186 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  42.07 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  46.5 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.48 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  44.79 
 
 		 215 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  44.44 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  45.06 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  43.79 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.03 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.03 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  43.04 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  41.98 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  39.07 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  49.08 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  44.59 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  40.69 
 
 		 187 aa  121  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  39.75 
 
 		 201 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  39.75 
 
 		 201 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  42.48 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  45.64 
 
 		 180 aa  120  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  46.01 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  41.83 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  41.83 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  41.83 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  41.83 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  41.83 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  38.51 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  41.83 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  43.95 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.74 
 
 		 187 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.74 
 
 		 187 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.51 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  43.71 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  43.04 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  43.75 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  45.4 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  38.82 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  36.24 
 
 		 147 aa  117  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  40 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  39.19 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  39.19 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  45.51 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  46.01 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  43.56 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  39.74 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  36.24 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  41.18 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  44.91 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  39.16 
 
 		 213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  39.64 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  43.66 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.14 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40.88 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  43.24 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  43.79 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  44.06 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.86 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  41.1 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  42.36 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  41.83 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  42.95 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  36.84 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  38.36 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  43.36 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  43.36 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  37.06 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  37.06 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  42.28 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  43.42 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  37.06 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  40.62 
 
 		 169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  41.18 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  40.25 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  44.52 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  39.24 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  40.14 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  48.85 
 
 		 197 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  37.41 
 
 		 202 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  36.2 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  40.59 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  38.85 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  36.42 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  36.2 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>