More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0906 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0906  peptide deformylase  100 
 
 
176 aa  360  5.0000000000000005e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000931901 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  43.75 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  42.68 
 
 
164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  44.51 
 
 
152 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.73 
 
 
170 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.73 
 
 
170 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  35.63 
 
 
178 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  36.36 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  42.04 
 
 
154 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  39.1 
 
 
150 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  41.45 
 
 
157 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  33.91 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  35.06 
 
 
170 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  38.46 
 
 
185 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  38.61 
 
 
152 aa  111  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  36.36 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  37.28 
 
 
167 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  38.46 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  35.26 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  42.11 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  42.77 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  37.87 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  36.81 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1508  peptide deformylase  41.76 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  37.36 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  41.45 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  34.68 
 
 
169 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  31.21 
 
 
170 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  39.75 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  37.42 
 
 
173 aa  108  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  35.84 
 
 
169 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  36.78 
 
 
167 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  36.78 
 
 
167 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  36.52 
 
 
173 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  36.21 
 
 
181 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  34.68 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  38.18 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  34.68 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  34.68 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  35.26 
 
 
177 aa  107  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  36.77 
 
 
190 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  40.79 
 
 
156 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2103  peptide deformylase  39.66 
 
 
163 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.614546  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  40.79 
 
 
156 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  40.79 
 
 
156 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  34.68 
 
 
169 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  40.79 
 
 
156 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  34.68 
 
 
169 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  36.21 
 
 
179 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  34.68 
 
 
169 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  35.29 
 
 
177 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  34.68 
 
 
169 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  34.68 
 
 
169 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  37.87 
 
 
185 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  38.96 
 
 
166 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  40 
 
 
163 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  38.65 
 
 
157 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  35.23 
 
 
170 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  35.63 
 
 
159 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  34.1 
 
 
169 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  36.9 
 
 
199 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  36.21 
 
 
167 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  40.79 
 
 
156 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  34.46 
 
 
170 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  35.03 
 
 
170 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  34.46 
 
 
170 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  38.46 
 
 
172 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  36.65 
 
 
167 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  34.1 
 
 
169 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  30.64 
 
 
199 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  38.71 
 
 
147 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  40.13 
 
 
156 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  40.13 
 
 
156 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  36.21 
 
 
167 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  35.06 
 
 
171 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.26 
 
 
154 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.27 
 
 
167 aa  103  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  35.84 
 
 
167 aa  104  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  36.21 
 
 
167 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  38.2 
 
 
166 aa  104  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2006  peptide deformylase  38.29 
 
 
163 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0958745  hitchhiker  0.000967888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  34.71 
 
 
178 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  36.77 
 
 
167 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  37.97 
 
 
170 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  30.86 
 
 
170 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.96 
 
 
187 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.96 
 
 
187 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  38.96 
 
 
170 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  32.18 
 
 
170 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  38.71 
 
 
147 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>