More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3731 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  74.5 
 
 		 200 aa  283  8e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  69.54 
 
 		 197 aa  276  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  67.17 
 
 		 195 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  67.51 
 
 		 197 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  64.97 
 
 		 197 aa  260  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  65.99 
 
 		 197 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  65.99 
 
 		 197 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  65.99 
 
 		 197 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  63.64 
 
 		 183 aa  241  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  60.71 
 
 		 190 aa  240  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  51.53 
 
 		 190 aa  187  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  53.57 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  50.79 
 
 		 192 aa  175  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  45.59 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  45.18 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  51.25 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  51.23 
 
 		 182 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  47.28 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  48.59 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  49.42 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  45.6 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  43.52 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.7 
 
 		 181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  43.43 
 
 		 230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  42.86 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  45.2 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  44.89 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  43.41 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  48.02 
 
 		 178 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  49.38 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  42.7 
 
 		 180 aa  121  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  41.11 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  47.13 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  48.75 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  47.85 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  45.29 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  42.22 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  39.2 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  39.2 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.57 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  41.34 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  39.77 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  41.9 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  40.76 
 
 		 230 aa  111  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  39.77 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  41.05 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  39.01 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  40.57 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  39.2 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  37.5 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  40.22 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  41.11 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  41.01 
 
 		 180 aa  106  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  37.37 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  38.2 
 
 		 166 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  44.7 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  43.45 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  40.11 
 
 		 161 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  41.57 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  41.36 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  38.76 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.88 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  36.26 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  40.88 
 
 		 162 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  41.51 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.75 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  39.89 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  39.75 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  38.79 
 
 		 157 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.13 
 
 		 167 aa  99  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  36.26 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  38.98 
 
 		 177 aa  98.2  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  40.88 
 
 		 159 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  41.01 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  39.16 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  38.12 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  39.87 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  36.07 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  40 
 
 		 158 aa  95.9  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  45.74 
 
 		 167 aa  96.3  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  37.85 
 
 		 171 aa  95.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  38.37 
 
 		 208 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  38.67 
 
 		 167 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  40.61 
 
 		 156 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  39.62 
 
 		 152 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  36.72 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  40 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  39.05 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  40 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  40 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  40 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  38.22 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.51 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  36 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  36.7 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  36.26 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  36.81 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  37.16 
 
 		 169 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  36.26 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>