More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5928 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  58.94 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  56.29 
 
 		 181 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  54.19 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  53.55 
 
 		 167 aa  163  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  54.66 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  54.97 
 
 		 182 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  51.92 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  52.26 
 
 		 188 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  54.3 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  52.56 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  55.92 
 
 		 182 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  56.85 
 
 		 186 aa  153  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  57.24 
 
 		 183 aa  153  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  55.48 
 
 		 186 aa  153  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  56.29 
 
 		 181 aa  150  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  48.75 
 
 		 183 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  50 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  51.59 
 
 		 204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  52.23 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  48.73 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  46.71 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  46.5 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  48.43 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  44.59 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  44.87 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  45.86 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  43.23 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  43.95 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  50 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  41.94 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  45.62 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  52.74 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  44.79 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  42.86 
 
 		 200 aa  120  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  44.22 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  42.76 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  41.4 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  45 
 
 		 213 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  44.87 
 
 		 195 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  45.03 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  40.69 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  40.91 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  42.11 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  36.99 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  42.41 
 
 		 173 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  41.14 
 
 		 188 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  44.38 
 
 		 182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  43.59 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.51 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  42.07 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  43.54 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  40.54 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.54 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  43.79 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  42.94 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  40 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  42.86 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  45.28 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  42.48 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  36.36 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  44.79 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  39.46 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  37.66 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.51 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.51 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.56 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  35.67 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  42.07 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.38 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  38.96 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  36.36 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.26 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  45.27 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  38.82 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  41.4 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  40.76 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  40.76 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  43.97 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  39.13 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.74 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  40.76 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  42.94 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  40.76 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  40.76 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  40.76 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  41.4 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  42.59 
 
 		 215 aa  104  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.88 
 
 		 190 aa  103  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  41.67 
 
 		 190 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  40.76 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  40.76 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  40 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  39.74 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  39.74 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  35.85 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.82 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  40.26 
 
 		 185 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  40.26 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  35.32 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>