More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1501 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  100 
 
 		 174 aa  350  5.9999999999999994e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  83.12 
 
 		 172 aa  285  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  69.87 
 
 		 172 aa  232  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  68.29 
 
 		 171 aa  228  3e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  58.05 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2160  peptide deformylase  60.13 
 
 		 171 aa  187  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  56.96 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  56.33 
 
 		 175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  56.33 
 
 		 175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  53.46 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  46.82 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  44.71 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  46.88 
 
 		 178 aa  151  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  44.71 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  47.06 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  43.53 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  46.82 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  46.82 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  44.12 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  46.24 
 
 		 168 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  47.34 
 
 		 167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  46.82 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  46.67 
 
 		 196 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  48.15 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  45.66 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  43.93 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  45.66 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  44.44 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  45.09 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  49.06 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  43.11 
 
 		 169 aa  141  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  45.81 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  45.81 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  42.11 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  44.94 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  42.69 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  46.71 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.51 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  46.88 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  40.83 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  42.51 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  42.51 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  42.68 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  41.52 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  42.07 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  43.53 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  42.68 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  46.58 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  45.86 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  40.46 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  47.33 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  42.68 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  42.68 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  42.68 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  42.68 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  42.68 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  42.68 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  40.94 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  40.94 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  41.88 
 
 		 170 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  41.88 
 
 		 170 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  45.96 
 
 		 180 aa  134  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  41.88 
 
 		 170 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  42.5 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  42.5 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  42.5 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  48.67 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  38.1 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  42.5 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  43.35 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  41.62 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  38.29 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  40.8 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  42.5 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  41.88 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  43.35 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  41.88 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  41.88 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  41.88 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  41.88 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  43.83 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  43.83 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  41.88 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  41.88 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  41.88 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  38.73 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  43.45 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  41.52 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  39.66 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  44.03 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  41.28 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  39.08 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  41.88 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  41.46 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  40.8 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  41.14 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  40.94 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  44.3 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>