More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0600 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  60.12 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  52.98 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  51.76 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  53.49 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  51.48 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  48.81 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  53.01 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  48.21 
 
 		 168 aa  163  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  48.21 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  49.11 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  49.7 
 
 		 168 aa  160  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  47.24 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  46.11 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  44.23 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  45.06 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  47.85 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  42.51 
 
 		 171 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  42.59 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  44.17 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  42.51 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  45.4 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  42.51 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  44.38 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  40.12 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  44.65 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  46.39 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  42.42 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  43.83 
 
 		 182 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  45.73 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  45.73 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  43.03 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  45.24 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  42.33 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  45.78 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  45.1 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  42.21 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2006  peptide deformylase  41.07 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0958745  hitchhiker  0.000967888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  44.72 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.31 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  45.73 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  45.91 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  42.33 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  43.29 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2103  peptide deformylase  42.86 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.614546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  44.72 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  43.29 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  45.1 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  42.77 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  45.73 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  45.1 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  43.79 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  47.4 
 
 		 154 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2387  peptide deformylase  43.45 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.29 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  42.68 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  42.68 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  40.4 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  43.29 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  44.51 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  41.1 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  42.94 
 
 		 177 aa  123  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  40.51 
 
 		 185 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  40.49 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  41.92 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  41.92 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  43.03 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  43.03 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  41.92 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  43.56 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  43.03 
 
 		 216 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2071  peptide deformylase  41.92 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0359728 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  43.03 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  41.92 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  41.1 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  44.51 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  41.67 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.66 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.66 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  41.1 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  43.03 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  43.03 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  43.03 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  43.03 
 
 		 179 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  41.46 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2142  peptide deformylase  41.1 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.644494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  43.45 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  40.49 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  42.07 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  41.76 
 
 		 191 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  44.16 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  40.51 
 
 		 185 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  42.33 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  40.51 
 
 		 185 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  41.03 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  37.89 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  41.82 
 
 		 181 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  40.61 
 
 		 187 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  44.17 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>