More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0528 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  100 
 
 		 169 aa  347  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  75.74 
 
 		 169 aa  274  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  75 
 
 		 168 aa  268  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  75.15 
 
 		 168 aa  267  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  75.74 
 
 		 168 aa  263  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  70.41 
 
 		 168 aa  250  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  69.82 
 
 		 168 aa  246  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  59.88 
 
 		 167 aa  206  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  51.48 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  51.48 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  48.48 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  47.09 
 
 		 177 aa  151  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  42.42 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  44.38 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  41.57 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  43.79 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  44.94 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  42.17 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  39.63 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  42.86 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  40.49 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  42.6 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  42.6 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  41.32 
 
 		 171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  40.36 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.77 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  40.96 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  46.15 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  42.01 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  38.92 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  42.59 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  40.96 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  41.92 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  39.52 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  37.35 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  43.98 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.32 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4706  formylmethionine deformylase  42.51 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  42.24 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.32 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4272  formylmethionine deformylase  41.92 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.203569  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  40.72 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  40.38 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.51 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  42.17 
 
 		 169 aa  120  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  40.96 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.96 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  43.29 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  42.01 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.32 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  41.03 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.82 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  40.72 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  40.72 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  41.33 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  39.16 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  40.96 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  36.94 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  37.89 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  37.58 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  38.55 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  36.94 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  41.32 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  38.06 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.67 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  36.09 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  39.74 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  41.56 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  40.36 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  41.03 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8573  formylmethionine deformylase  43.33 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  43.97 
 
 		 152 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  43.98 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  40.38 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  42.17 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  41.18 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  37.58 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  44.44 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  41.18 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  37.58 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  39.49 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  40.91 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000249  peptide deformylase  37.35 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  40.91 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  40.72 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  42.51 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  41.03 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  42.51 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  34.13 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  44.16 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  41.03 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  42.86 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  41.29 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  39.22 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  37.35 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  37.35 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  37.35 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  39.52 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  37.35 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  37.35 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>