More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0895 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  100 
 
 		 169 aa  343  5e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  51.76 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  51.76 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  47.09 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  46.75 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  46.39 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  43.56 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  39.64 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  42.94 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  39.64 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  42.42 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  42.42 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  44.44 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  43.48 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  42.5 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  43.2 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2142  peptide deformylase  43.2 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.644494 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  43.2 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  43.2 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  45.1 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  45.1 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  45.1 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  45.1 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2071  peptide deformylase  45.1 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0359728 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  42.11 
 
 		 172 aa  124  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  40.24 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  40.49 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  44.44 
 
 		 191 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2103  peptide deformylase  41.18 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.614546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  38.89 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  37.35 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  40.96 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2387  peptide deformylase  41.29 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  38.99 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  42.11 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  41.42 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4706  formylmethionine deformylase  38.41 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  38.24 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  40.52 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  36.47 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  40.34 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  39.22 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  36.69 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  36.69 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  42.31 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  39.77 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  40.52 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0407  peptide deformylase  38.56 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2006  peptide deformylase  39.05 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0958745  hitchhiker  0.000967888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  36.26 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  38.92 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  37.65 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  38.79 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  37.87 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  36.84 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  40.52 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4272  formylmethionine deformylase  37.8 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.203569  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000249  peptide deformylase  36.6 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  38.31 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  37.28 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  41.36 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  34.87 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  36.42 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  36.31 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  40.26 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  41.36 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  39.62 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  37.91 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  40.65 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  37.13 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  39.87 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  36.18 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  37.13 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  38.31 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  40.26 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  41.03 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  39.22 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  40.83 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  39.61 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  40 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  40 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  40 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  35.93 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  35.95 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  40 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  34.68 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  35.53 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  37.27 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  37.66 
 
 		 216 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  39.35 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  39.61 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  39.35 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  37.66 
 
 		 179 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  37.66 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  37.66 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  35.29 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  34.18 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  37.01 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  37.66 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>