More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3495 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  370  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  53.49 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  53.49 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  50.61 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  47.09 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  47.09 
 
 		 169 aa  151  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  42.11 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  46.75 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  42.77 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  45.51 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  49.65 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  42.69 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  43.53 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  41.24 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  40.68 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  37.29 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  39.16 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  38.85 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  39.43 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  41.21 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  36.72 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  37.29 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  42.29 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  36.63 
 
 		 163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  36.63 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  36.63 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2142  peptide deformylase  36.63 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.644494 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  35.44 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  37.21 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  36.84 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  35.44 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  36.26 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  36.13 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  35.19 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  34.83 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  44.27 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  36.63 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2071  peptide deformylase  36.63 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0359728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  36.63 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0898  peptide deformylase  36.13 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  36.63 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  34.08 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  38.65 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  38.51 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2006  peptide deformylase  35.23 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0958745  hitchhiker  0.000967888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  36.72 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0407  peptide deformylase  33.71 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447377  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  38.51 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.51 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  40.51 
 
 		 169 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000249  peptide deformylase  34.83 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2103  peptide deformylase  34.91 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.614546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  36.93 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  39.08 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  38.41 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  36.78 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  37.93 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4706  formylmethionine deformylase  41.3 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  35.59 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  32.28 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4272  formylmethionine deformylase  37.85 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.203569  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  35.23 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  36.87 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  35.59 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  34.83 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  35.06 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  35.06 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  34.18 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  36.78 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2387  peptide deformylase  36.05 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  39.13 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  32.77 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  35.33 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  37.95 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  38.22 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  36.77 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  37.29 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  35.03 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  36.31 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  36.81 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  37.29 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  37.29 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  33.71 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  34.46 
 
 		 170 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  34.46 
 
 		 170 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  33.71 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  38.67 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  38.17 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  38.67 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  39.49 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  37.78 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  35.59 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  36.94 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  37.58 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  38.46 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  37.58 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  37.58 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  37.58 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  33.71 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.71 
 
 		 187 aa  97.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>