More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4272 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4272  formylmethionine deformylase  100 
 
 		 187 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.203569  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4706  formylmethionine deformylase  89.84 
 
 		 187 aa  336  9e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8573  formylmethionine deformylase  52.47 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  41.92 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  40.36 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  40.36 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  40.96 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  42.17 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  39.76 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  37.8 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  38.55 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  41.18 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  41.18 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  36.88 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  37.85 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  42.96 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  42.5 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  41.33 
 
 		 154 aa  97.8  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  38.31 
 
 		 173 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  38.16 
 
 		 157 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  28.83 
 
 		 164 aa  94.4  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  39.22 
 
 		 166 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  37.11 
 
 		 152 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  33.74 
 
 		 171 aa  91.7  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  33.54 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  38.96 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  36 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  35.71 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  36.75 
 
 		 167 aa  89  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  35.33 
 
 		 147 aa  89  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  37.01 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  38.82 
 
 		 156 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  36.36 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  35.98 
 
 		 172 aa  87.8  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  35.98 
 
 		 172 aa  88.2  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  41.55 
 
 		 155 aa  88.2  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0898  peptide deformylase  33.99 
 
 		 167 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  35.1 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  37.91 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.06 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  39.47 
 
 		 157 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  38.16 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  34.87 
 
 		 240 aa  85.9  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  37.25 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  37.25 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  37.25 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  37.66 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  37.66 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  37.25 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  40.13 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  40.13 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  35.37 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  33.99 
 
 		 153 aa  84.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  34.38 
 
 		 167 aa  84.3  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  33.77 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  34.38 
 
 		 167 aa  84.3  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  37.25 
 
 		 158 aa  84.3  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  35.06 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  42.64 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  36.6 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  36.6 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  40 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  40.76 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  33.77 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0407  peptide deformylase  32.68 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  33.12 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  34.9 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  33.12 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  32.12 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  35.62 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  33.54 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  39.33 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  31.61 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  33.77 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  32.03 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  31.52 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  34.55 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  31.33 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  34.44 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  41.27 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  35.8 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  33.55 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  36.71 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  35.8 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  40.56 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  34.67 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  30.77 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1277  peptide deformylase  36.6 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  33.33 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  29.8 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  41.48 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3966  peptide deformylase  35.95 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  33.77 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  32.9 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>