More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8573 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8573  formylmethionine deformylase  100 
 
 		 174 aa  337  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4272  formylmethionine deformylase  52.47 
 
 		 187 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.203569  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4706  formylmethionine deformylase  50.62 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  48 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  43.33 
 
 		 169 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  42.11 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  42.11 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  42.76 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  40.79 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  40.91 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  41.5 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  43.33 
 
 		 168 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  38.62 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  37.34 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  40.37 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  40 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  40.38 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  38.19 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  36.71 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  34.73 
 
 		 202 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  36.81 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  38.19 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  34.73 
 
 		 202 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  33.94 
 
 		 201 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.58 
 
 		 164 aa  97.4  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  35.4 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  30.92 
 
 		 164 aa  97.4  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  37.58 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  35 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  38.78 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  40.41 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  36.91 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  38.51 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  43.2 
 
 		 177 aa  95.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  38.32 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  36.25 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  37.5 
 
 		 201 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  38.67 
 
 		 167 aa  94.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  38.67 
 
 		 167 aa  94.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  37.74 
 
 		 201 aa  94.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  35.62 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  35.62 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  35.62 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  35.62 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0898  peptide deformylase  34.87 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  38.31 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  34.94 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  34.15 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  34.15 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  39.87 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  38.16 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  38.16 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  39.73 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  35.62 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  36.99 
 
 		 199 aa  90.9  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  37.5 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  35 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  35 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  34.64 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  36.11 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  37.18 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3966  peptide deformylase  36.25 
 
 		 156 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  33.33 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  38.52 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  31.33 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  40.82 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  37.35 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  40.25 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  34.15 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1277  peptide deformylase  35.62 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  39.86 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  38.36 
 
 		 188 aa  87.8  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  32.24 
 
 		 150 aa  87.8  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  35.9 
 
 		 171 aa  87.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  35.5 
 
 		 196 aa  87.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.85 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  41.77 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  31.82 
 
 		 240 aa  87  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  40.14 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  37.91 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.81 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  38.41 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  36.09 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  36.94 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  33.99 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  37.27 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  42.21 
 
 		 209 aa  86.3  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  34.42 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  38.41 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  37.75 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  35.26 
 
 		 171 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  37.01 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  42.18 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  41.1 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  40.41 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  43.31 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  32.68 
 
 		 151 aa  85.1  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  39.86 
 
 		 181 aa  84.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  37.09 
 
 		 178 aa  85.1  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  35.85 
 
 		 157 aa  85.1  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>