More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0492 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  100 
 
 		 164 aa  333  5e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  42.94 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  43.12 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  40.24 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  44.85 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  46.67 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  39.26 
 
 		 185 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  39.63 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  42.86 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  39.02 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  38.04 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  43.9 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  39.63 
 
 		 169 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  43.48 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  39.26 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  42.68 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  43.48 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  43.83 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  42.33 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  42.33 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  38.65 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  42.68 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  41.94 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  41.45 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  42.31 
 
 		 189 aa  118  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  39.26 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  39.16 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.38 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  39.49 
 
 		 178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  39.26 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  37.65 
 
 		 169 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  42.66 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  40.76 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000249  peptide deformylase  38.71 
 
 		 168 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  38.85 
 
 		 184 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  37.42 
 
 		 173 aa  110  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  38.56 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  39.88 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2387  peptide deformylase  39.35 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  39.88 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0407  peptide deformylase  39.35 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  40.13 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  37.34 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  38.06 
 
 		 168 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  37.91 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  37.42 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  38.71 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  36.08 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.46 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  37.42 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  36.77 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  37.5 
 
 		 173 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0898  peptide deformylase  37.42 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  38.82 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  39.61 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2142  peptide deformylase  37.42 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.644494 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  37.42 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  41.18 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  39.87 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  40.52 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  38.04 
 
 		 172 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40.38 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  39.74 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  41.14 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  37.95 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40.38 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.03 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  40.52 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2006  peptide deformylase  36.77 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0958745  hitchhiker  0.000967888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  38.46 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  40.79 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  37.65 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2160  peptide deformylase  37.65 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  38.12 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  38.06 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  41.18 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  39.22 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  41.03 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  36.77 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  41.18 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  38.96 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2071  peptide deformylase  36.77 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0359728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  36.77 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  36.77 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  39.51 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  39.87 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  36.77 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.38 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  35.1 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  39.87 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  41.03 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  33.54 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.74 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  39.1 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  38.06 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  35.62 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  37.91 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  40.38 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  36 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  39.87 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>