More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0021 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  339  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  70.06 
 
 		 167 aa  236  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  69.05 
 
 		 167 aa  224  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  67.88 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  67.88 
 
 		 167 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  67.88 
 
 		 216 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  67.27 
 
 		 181 aa  218  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  67.88 
 
 		 167 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  67.88 
 
 		 167 aa  217  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  67.88 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  67.88 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  67.27 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  67.27 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  66.67 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  66.67 
 
 		 179 aa  215  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  66.67 
 
 		 167 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  65.48 
 
 		 171 aa  213  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  66.67 
 
 		 167 aa  213  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  66.06 
 
 		 167 aa  213  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  65.48 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  65.85 
 
 		 167 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  62.28 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  65.64 
 
 		 169 aa  210  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  65.24 
 
 		 177 aa  208  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  60.71 
 
 		 168 aa  207  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  61.31 
 
 		 168 aa  207  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  62.5 
 
 		 168 aa  205  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  59.39 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  63.64 
 
 		 168 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  60.61 
 
 		 171 aa  204  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  62.2 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  60.71 
 
 		 168 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  60.71 
 
 		 168 aa  204  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  61.82 
 
 		 169 aa  204  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  61.59 
 
 		 167 aa  203  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  60.61 
 
 		 168 aa  202  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  59.28 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  59.52 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  60.12 
 
 		 168 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  58.33 
 
 		 172 aa  200  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  60.98 
 
 		 191 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  61.82 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  56.71 
 
 		 167 aa  197  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  58.33 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  58.79 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  58.33 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  59.39 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  59.39 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  58.33 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  56.89 
 
 		 167 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  58.68 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  58.08 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  57.74 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  58.68 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  57.06 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  57.58 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  58.02 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  56.47 
 
 		 170 aa  190  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  56.29 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  57.67 
 
 		 170 aa  189  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  57.41 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  54.49 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  57.23 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  56.47 
 
 		 178 aa  187  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  53.89 
 
 		 170 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  59.52 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  56.17 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  57.58 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  53.29 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  56.55 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  54.88 
 
 		 167 aa  185  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  58.68 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  55.15 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  55.15 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  53.29 
 
 		 168 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  53.29 
 
 		 168 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  53.29 
 
 		 168 aa  180  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0833  peptide deformylase  60.61 
 
 		 170 aa  180  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  52.1 
 
 		 168 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  56.02 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  56.02 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  54.49 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  54.49 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  54.49 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  54.49 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  54.49 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  51.83 
 
 		 169 aa  178  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  54.49 
 
 		 169 aa  177  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  51.5 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  50.9 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  50.9 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  55.76 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  50.9 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  50.9 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  53.89 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  53.89 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  53.89 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  53.89 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  53.89 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  53.89 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>