More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2534 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  343  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  60.61 
 
 		 168 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  59.88 
 
 		 169 aa  206  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  60.61 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  58.08 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  58.43 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  56.36 
 
 		 168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  55.76 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  53.01 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  53.01 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  46.34 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  46.67 
 
 		 167 aa  150  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  46.75 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  46.06 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  42.94 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  47.27 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  49.7 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  44.24 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  47.2 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  43.64 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  43.03 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  42.42 
 
 		 185 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  44.44 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  42.42 
 
 		 185 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.36 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  44.3 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  44.85 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  43.21 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  41.21 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  46.63 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  44.44 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.55 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  45.45 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  45.45 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  45.4 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  43.21 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  45.4 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  39.76 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  43.64 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  42.42 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  42.86 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  47.4 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000249  peptide deformylase  41.82 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  43.4 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  41.21 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  42.26 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.37 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  45.18 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  41.82 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  44.16 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  39.18 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  43.03 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  41.82 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  40.62 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  40.69 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  42.42 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  39.39 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  39.39 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  39.39 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  39.39 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  39.39 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  39.29 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  37.97 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  37.72 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  40 
 
 		 167 aa  124  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  39.88 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  39.75 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  40 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  40 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  38.96 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  38.79 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  44.16 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  41.56 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  43.51 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.35 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  43.11 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  38.79 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.35 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  41.92 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  37.58 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  43.11 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  41.32 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  40 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  43.11 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  37.58 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  43.11 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  40 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2071  peptide deformylase  43.11 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0359728 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  37.58 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  42.48 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>