More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2233 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  100 
 
 		 173 aa  347  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  51.81 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  46.15 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  47.31 
 
 		 172 aa  150  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  46.11 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  45.61 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  46.91 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  47.31 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  47.77 
 
 		 176 aa  147  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  47.31 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  45.24 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  44.31 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  45.51 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  46.95 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  44.31 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  44.31 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  48.73 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  46.11 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  45.24 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  43.45 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  46.3 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  45.24 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  46.11 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  46.3 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  44.91 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  45.12 
 
 		 169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  44.64 
 
 		 169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  44.31 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  43.45 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  44.05 
 
 		 168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  44.05 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45.45 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  46.06 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  44.51 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  45.93 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  48.17 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  48.17 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  48.48 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  43.9 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  42.86 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  45.4 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  43.9 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  43.9 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  43.6 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  46.11 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  45.83 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  43.02 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  43.45 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  42.69 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  41.07 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  42.26 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  42.68 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  44.05 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  42.68 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  42.68 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  42.68 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  42.86 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  41.52 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  44.31 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  42.26 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  42.26 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  42.26 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  46.34 
 
 		 178 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  44.51 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  45.45 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  44.05 
 
 		 170 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  42.07 
 
 		 170 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.69 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  45.51 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.69 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  41.32 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  46.06 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  44.38 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  46.06 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  42.07 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  44.38 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  41.92 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  42.68 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  46.06 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  40.48 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  43.29 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  46.75 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  45.12 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  43.9 
 
 		 169 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>