More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1591 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  100 
 
 		 172 aa  348  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  56.16 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  60.69 
 
 		 170 aa  160  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  58.04 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  50.31 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  54.74 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  53.24 
 
 		 154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  53.96 
 
 		 152 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  56.08 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  51.7 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  50.98 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  50.72 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  58.04 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  50.75 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  52.41 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  51.09 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  53.08 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  51.37 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  48.95 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  48.95 
 
 		 156 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  48.95 
 
 		 156 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  48.25 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  49.65 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  48.25 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  48.25 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  48.25 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  48.95 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  50 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  45.33 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  46.9 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  50 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  44.97 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  44.97 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  48.2 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  46.58 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  46.76 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  49.26 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  47.3 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  49.26 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  43.33 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.86 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.86 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.14 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  45 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  40.69 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  43.23 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  43.79 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  43.62 
 
 		 167 aa  124  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  47.1 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  45.83 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  47.86 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  47.48 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  45.32 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2103  peptide deformylase  44.3 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.614546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  44.97 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  44.14 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.69 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  47.48 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  46.76 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1277  peptide deformylase  47.55 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3966  peptide deformylase  47.83 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  41.26 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  47.86 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  44.6 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  47.86 
 
 		 181 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  41.26 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  43.66 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  43.42 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  44.37 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  47.14 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0024  peptide deformylase  39.33 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  43.66 
 
 		 185 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  43.84 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  44.81 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  44.81 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  44.81 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  40.67 
 
 		 170 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  43.95 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  44.81 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  43.95 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  44.81 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  45.26 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  45 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  46.43 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  44.3 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>