More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3456 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  100 
 
 		 169 aa  345  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  81.66 
 
 		 168 aa  287  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  75.74 
 
 		 169 aa  274  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  75.74 
 
 		 168 aa  273  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  76.19 
 
 		 168 aa  268  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  72.19 
 
 		 168 aa  258  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  71.6 
 
 		 168 aa  255  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  58.08 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  49.11 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  49.11 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  49.7 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  42.94 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  46.84 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  47.83 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  45.4 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  44.17 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  40.85 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  42.86 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  44.58 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  43.79 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  45.18 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  44.51 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  46.63 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  42.6 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  45.73 
 
 		 185 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  42.6 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  40.61 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  43.11 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  43.11 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  41.14 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  45.12 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  46.01 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  46.01 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  41.18 
 
 		 171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  44.51 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  42.51 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  43.2 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  43.67 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  42.42 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  43.11 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  40.72 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  39.39 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  44.81 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.82 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  45.18 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  45 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  45.78 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  41.76 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  41.76 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  41.18 
 
 		 196 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  41.25 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  43.12 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  44.87 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  41.21 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  42.94 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  39.88 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4706  formylmethionine deformylase  42.77 
 
 		 187 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  40.12 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  45.45 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  45.45 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  44.71 
 
 		 171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  44.12 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.06 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  39.26 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  41.46 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.06 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  44.71 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  39.38 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  40.96 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  40.96 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  44.44 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  38.46 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  43.64 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  43.9 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  36.63 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  39.52 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2070  peptide deformylase  41.18 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  38.92 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  42.94 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  36.47 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  38.85 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  38.92 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  38.95 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4272  formylmethionine deformylase  40.96 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.203569  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  39.41 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  43.12 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  40.12 
 
 		 170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  37.87 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>