More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0184 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  100 
 
 		 175 aa  353  5e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  100 
 
 		 175 aa  353  5e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  99.43 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  70.44 
 
 		 173 aa  226  9e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  60.57 
 
 		 171 aa  208  4e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  61.78 
 
 		 172 aa  194  7e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  54.97 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  56.88 
 
 		 174 aa  184  5e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  54.04 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2160  peptide deformylase  51.95 
 
 		 171 aa  160  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  43.35 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  43.68 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  43.1 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  42.86 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  43.79 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  42.44 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  42.78 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  42.53 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  42.01 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  42.35 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  41.42 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  41.95 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  43.95 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  41.76 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  41.18 
 
 		 174 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  44.31 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  43.27 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  42.77 
 
 		 172 aa  134  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  41.32 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  43.71 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  42.95 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  42.7 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40.72 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40.72 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  39.16 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  40.83 
 
 		 175 aa  131  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  41.82 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  36.47 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  39.41 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  42.26 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40.72 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  41.32 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40.72 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  43.64 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  41.28 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  41.21 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  38.95 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  40.7 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  43.45 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  43.45 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  41.32 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  41.32 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  38.69 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  42.35 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.33 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  41.32 
 
 		 168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  37.87 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  37.87 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  39.39 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  39.77 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  40.61 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.66 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  38.15 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  37.5 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.66 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  43.79 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  41.82 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  39.53 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  40.74 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  39.31 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  41.98 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  40.74 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  39.52 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  41.98 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  40.74 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  39.89 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  41.04 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  49.32 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  36.09 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  41.21 
 
 		 168 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  38.82 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  37.43 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  44.37 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  39.18 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  40.12 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  38.95 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  37.21 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  42.86 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  39.18 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  40.74 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  37.21 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  43.06 
 
 		 152 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  40.46 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  39.78 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  38.46 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  40.74 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  43.64 
 
 		 178 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  43.71 
 
 		 157 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  36.63 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  39.41 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>