More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3120 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  68.36 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  63.28 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  64.41 
 
 		 188 aa  224  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  61.02 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  62.15 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  61.02 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  61.02 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  62.15 
 
 		 180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  61.8 
 
 		 183 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  60.45 
 
 		 182 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  56.5 
 
 		 183 aa  204  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  62.15 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  59.87 
 
 		 161 aa  188  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  56.17 
 
 		 180 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  53.7 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  50.62 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  54.27 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  51.23 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  51.83 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  50.62 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  49.69 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  53.09 
 
 		 197 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  49.06 
 
 		 164 aa  160  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  50 
 
 		 162 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  47.83 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  44.94 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  44.12 
 
 		 230 aa  147  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  52.74 
 
 		 191 aa  144  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  47.56 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  45.08 
 
 		 215 aa  141  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  44.44 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  49.04 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  49.34 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  46.75 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  43.04 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  47.4 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  43.85 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  43.85 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  50.33 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  46.63 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  46.86 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  42.76 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  39.57 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  40.11 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  40.64 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  43.68 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  44.38 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  42.45 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  46.67 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  46.15 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  46.63 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  38.24 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  41.14 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  38.14 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  45.52 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  40.98 
 
 		 230 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  42.67 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.36 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  42.68 
 
 		 225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  48.39 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  38.66 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.36 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  45.75 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.54 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  41.06 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  42.67 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  41.45 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  40.21 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  42.66 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  40.21 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  40.21 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  39.73 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  45.4 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  39.73 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  43.23 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  42.11 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.24 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  40.79 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  39.57 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.78 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  38.41 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  39.58 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  43.84 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  39.69 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  42.07 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  41.46 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  40.44 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  36.99 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  47.47 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  41.21 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  39.19 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  45.58 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  44.05 
 
 		 221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  39.19 
 
 		 201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  39.19 
 
 		 201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.31 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.31 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.4 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>