More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0873 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0873  peptide deformylase  100 
 
 
190 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.905426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  46.47 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  46.43 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  43.86 
 
 
182 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.35 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  40.46 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  42.07 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  41.03 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  41.03 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  41.88 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  40.51 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  43.03 
 
 
186 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  40.12 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  39.63 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  39.87 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  41.83 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40.96 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  40.59 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  41.78 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  44.72 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  40.96 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  41.56 
 
 
167 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  43.12 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  43.33 
 
 
155 aa  111  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  39.49 
 
 
166 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  40.26 
 
 
167 aa  111  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.91 
 
 
167 aa  111  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.86 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  44.08 
 
 
185 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  39.51 
 
 
175 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  39.77 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  42.76 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.28 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.75 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  40.85 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.24 
 
 
174 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  42.68 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  39.41 
 
 
190 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  43.31 
 
 
188 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  39.16 
 
 
177 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0868  peptide deformylase  38.24 
 
 
180 aa  106  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.184037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  38.26 
 
 
153 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  38 
 
 
201 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  40.24 
 
 
169 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  41.32 
 
 
177 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  41.32 
 
 
177 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  36.81 
 
 
188 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  36.99 
 
 
202 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  41.56 
 
 
177 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  39.05 
 
 
172 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  36.99 
 
 
202 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  41.56 
 
 
177 aa  104  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  43.75 
 
 
168 aa  104  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  41.52 
 
 
181 aa  104  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  43.04 
 
 
162 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  42.14 
 
 
188 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  40.54 
 
 
159 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  35.37 
 
 
189 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  42.48 
 
 
177 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  35.37 
 
 
169 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  41.25 
 
 
180 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  40.72 
 
 
182 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  40.24 
 
 
171 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40.41 
 
 
192 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  41.22 
 
 
156 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.67 
 
 
164 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1508  peptide deformylase  33.14 
 
 
177 aa  102  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  36.25 
 
 
171 aa  101  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  36.9 
 
 
188 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  40.74 
 
 
169 aa  101  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  36.97 
 
 
177 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  40.69 
 
 
165 aa  101  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  42.58 
 
 
177 aa  101  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  38.61 
 
 
173 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  40.24 
 
 
169 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  39.6 
 
 
201 aa  101  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  38.92 
 
 
177 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  35.57 
 
 
201 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  40.13 
 
 
150 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  42.35 
 
 
167 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  41.07 
 
 
185 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  43.33 
 
 
209 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  45.24 
 
 
181 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  39.49 
 
 
170 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  39.44 
 
 
215 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  42.95 
 
 
167 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  40 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  40.14 
 
 
169 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  38.82 
 
 
175 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  32.78 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  40.24 
 
 
166 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  33.73 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  38.89 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  42.21 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  41.82 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  41.82 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  32.73 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  42.21 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>