More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1508 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1508  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  356  9e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  49.7 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  45.56 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  44.77 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  44.12 
 
 		 171 aa  141  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  44.07 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  44.51 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  44.07 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  45.18 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  43.35 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  44.58 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  43.37 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  45.18 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  40.68 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2103  peptide deformylase  46.99 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.614546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  42.2 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  46.31 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  42.77 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2387  peptide deformylase  47.9 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  40.12 
 
 		 178 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  41.82 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  41.57 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  44.03 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  41.18 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  42.14 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  40.7 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  43.67 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  43.67 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  41.82 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  43.67 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  41.82 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  45.56 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  43.67 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  41.82 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  43.67 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  43.87 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2142  peptide deformylase  44.38 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.644494 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  44.38 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  44.38 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  43.04 
 
 		 169 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  45.56 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2071  peptide deformylase  45.56 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0359728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  45.56 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  45.56 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  43.04 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  43.04 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  43.04 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  43.79 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  43.04 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  43.04 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  43.04 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  43.04 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  43.04 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  43.04 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  43.37 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  45.18 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  40.57 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  45.16 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.71 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.71 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  38.46 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  38.82 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  38.82 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.14 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  41.77 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  45.22 
 
 		 157 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  38.46 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40.57 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  41.77 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  41.57 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  37.65 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.63 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  41.1 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  39.39 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.63 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  37.65 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  37.65 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  37.65 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  37.87 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  37.87 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  40.23 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  40.23 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  37.87 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  41.18 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  37.87 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  40.57 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  39.64 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2006  peptide deformylase  42.01 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0958745  hitchhiker  0.000967888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  37.36 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  41.83 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  39.76 
 
 		 177 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  40.83 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.89 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  38.15 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  35.84 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  37.95 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  41.76 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.52 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  39.88 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  44.3 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>