More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1713 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  63.48 
 
 		 180 aa  243  9e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  64.37 
 
 		 175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0868  peptide deformylase  50 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.184037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.18 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  36.47 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  39.39 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  36.47 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  43.31 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  36.57 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  40.25 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  38.79 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  40.62 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  40.25 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  38.79 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  41.83 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  37.04 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  37.58 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  38.62 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.58 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.58 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0873  N-formylmethionyl tRNA deformylase  42.33 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  39.22 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  38.62 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  41.03 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  40 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2579  peptide deformylase  40.27 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231026  hitchhiker  0.00000660539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2533  peptide deformylase  41.72 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.123304  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  41.01 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  40.65 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  37.28 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  37.41 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  37.16 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  39.89 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  33.52 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  39.35 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  41.73 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  40.15 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  38.56 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  36.73 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.18 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  38.67 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  41.27 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  38.32 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  36.77 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  38.73 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  37.5 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.18 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  38.85 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  37.91 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  38.06 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  33.55 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1032  peptide deformylase  36.2 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  39.56 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  36.54 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  38.71 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  37.75 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  41.1 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  39.1 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  37.82 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  37.42 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  36.14 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  36.97 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  38.3 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  36.77 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.75 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.75 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  39.68 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  38.71 
 
 		 150 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  36.13 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  42.86 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  38.71 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  39.68 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  36.54 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.67 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  34.64 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  39.86 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  40.67 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  36.77 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  36.77 
 
 		 172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  33.33 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  36.77 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  36.77 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  33.93 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  36.67 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  36.31 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  36.99 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  40.48 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  39.74 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  36.88 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  36.43 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  34.32 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  36.77 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  33.51 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  36.71 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  36.6 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  34.52 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  42 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  33.92 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>